More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1732 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 864 aa  1768    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2076  TonB-dependent receptor  99.62 
 
 		 533 aa  1102    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  39.43 
 
 		 844 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  38.16 
 
 		 841 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  39.17 
 
 		 836 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  37.86 
 
 		 841 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  39.91 
 
 		 841 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  53.74 
 
 		 507 aa  486  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0661  TonB-dependent receptor  62.47 
 
 		 379 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 		 840 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 		 826 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.56 
 
 		 812 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  37.71 
 
 		 803 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  34.55 
 
 		 824 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.37 
 
 		 825 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  34.95 
 
 		 821 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  34.23 
 
 		 825 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 828 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  35.53 
 
 		 800 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 		 727 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 831 aa  425  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 		 738 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 828 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 		 738 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  36.09 
 
 		 720 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  35.72 
 
 		 713 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  36.1 
 
 		 745 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 841 aa  415  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  33.22 
 
 		 810 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  34.1 
 
 		 833 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 822 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 		 814 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.77 
 
 		 747 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 		 816 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 		 802 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.92 
 
 		 743 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 		 746 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  33.56 
 
 		 817 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.48 
 
 		 752 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  34.48 
 
 		 719 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 830 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  34.48 
 
 		 719 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 703 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  31.54 
 
 		 802 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 826 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  33.69 
 
 		 808 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  33.66 
 
 		 799 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 803 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  33.13 
 
 		 809 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 822 aa  379  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 819 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 		 803 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 795 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  32.71 
 
 		 815 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.45 
 
 		 812 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  33.55 
 
 		 722 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 717 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 801 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 722 aa  346  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  32.06 
 
 		 807 aa  343  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 806 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 827 aa  342  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 		 798 aa  340  9e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 724 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 787 aa  326  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  29.87 
 
 		 789 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  31.89 
 
 		 766 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 		 732 aa  311  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 778 aa  311  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 730 aa  310  6.999999999999999e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  32.64 
 
 		 753 aa  301  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 		 753 aa  300  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 741 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 		 725 aa  294  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 		 748 aa  293  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 840 aa  292  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 722 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 729 aa  291  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  30.08 
 
 		 744 aa  289  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 724 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 714 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 731 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.59 
 
 		 729 aa  283  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 729 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.88 
 
 		 729 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.72 
 
 		 729 aa  283  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  31.54 
 
 		 699 aa  283  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.72 
 
 		 729 aa  283  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.17 
 
 		 724 aa  283  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.17 
 
 		 724 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.77 
 
 		 724 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.91 
 
 		 724 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 722 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.77 
 
 		 724 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 693 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.59 
 
 		 729 aa  281  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.59 
 
 		 729 aa  281  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  29.59 
 
 		 729 aa  281  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.59 
 
 		 729 aa  281  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 693 aa  280  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>