More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4217 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  100 
 
 		 812 aa  1679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  53.86 
 
 		 722 aa  730    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  51.5 
 
 		 717 aa  715    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  52.14 
 
 		 724 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  53.23 
 
 		 722 aa  705    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  49.19 
 
 		 802 aa  743    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  41.97 
 
 		 810 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  38.85 
 
 		 822 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  40.12 
 
 		 815 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  37.98 
 
 		 824 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  40.31 
 
 		 819 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  38.7 
 
 		 807 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  39.78 
 
 		 802 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  40.31 
 
 		 816 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  39.48 
 
 		 814 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  37.47 
 
 		 826 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 844 aa  506  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  36.65 
 
 		 808 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  39.41 
 
 		 799 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  38.45 
 
 		 840 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  37.81 
 
 		 825 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  36.52 
 
 		 812 aa  492  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 828 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  37.77 
 
 		 831 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  36.28 
 
 		 822 aa  489  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  37.28 
 
 		 789 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  37.53 
 
 		 798 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 		 803 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  34.9 
 
 		 841 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  34.79 
 
 		 841 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 795 aa  472  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 		 806 aa  469  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  36.42 
 
 		 828 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  36.76 
 
 		 830 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  37.87 
 
 		 833 aa  465  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 		 703 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  37.49 
 
 		 817 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  38.5 
 
 		 766 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 		 821 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  37.67 
 
 		 803 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 		 864 aa  450  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 		 826 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  36.05 
 
 		 803 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  37.34 
 
 		 801 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  34.94 
 
 		 836 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  36.36 
 
 		 713 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.22 
 
 		 825 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 841 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  36.12 
 
 		 800 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  35.23 
 
 		 720 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  35.32 
 
 		 827 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.85 
 
 		 743 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 		 745 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  36.48 
 
 		 741 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  36.29 
 
 		 732 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 747 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  36.34 
 
 		 741 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  36.6 
 
 		 747 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  38.13 
 
 		 746 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 841 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  36.23 
 
 		 753 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 809 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  35.36 
 
 		 752 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  35.14 
 
 		 747 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 738 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 		 727 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 738 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  36.23 
 
 		 753 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.29 
 
 		 719 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.29 
 
 		 719 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 787 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  36.12 
 
 		 765 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.89 
 
 		 729 aa  392  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 		 729 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  35.6 
 
 		 737 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.89 
 
 		 729 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 		 723 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.89 
 
 		 729 aa  392  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  36.09 
 
 		 748 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.89 
 
 		 729 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  36.6 
 
 		 747 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.11 
 
 		 728 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.89 
 
 		 729 aa  392  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.89 
 
 		 729 aa  392  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.89 
 
 		 729 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  34.89 
 
 		 729 aa  392  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 765 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  35.52 
 
 		 699 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  37.36 
 
 		 725 aa  389  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 765 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  37.22 
 
 		 735 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 		 737 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  34.32 
 
 		 740 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 		 714 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 		 737 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  35.85 
 
 		 737 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  35.56 
 
 		 700 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 		 724 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.09 
 
 		 724 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.09 
 
 		 724 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>