More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0759 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  51.32 
 
 		 825 aa  800    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  53.17 
 
 		 743 aa  724    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  52.23 
 
 		 803 aa  808    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  52.68 
 
 		 746 aa  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  45.13 
 
 		 821 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 800 aa  1642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  39.09 
 
 		 825 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  39.05 
 
 		 828 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  38.93 
 
 		 828 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  39.42 
 
 		 840 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  40.24 
 
 		 809 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  38.03 
 
 		 810 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  39.62 
 
 		 826 aa  495  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  37.63 
 
 		 841 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  37.47 
 
 		 824 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  37.46 
 
 		 841 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  36.91 
 
 		 826 aa  465  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  36.78 
 
 		 844 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  36.28 
 
 		 802 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 		 814 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  38.93 
 
 		 722 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  36.02 
 
 		 812 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  36.19 
 
 		 815 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  36.7 
 
 		 789 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 		 806 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  35.4 
 
 		 830 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  35.59 
 
 		 819 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  39.04 
 
 		 717 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  34.77 
 
 		 864 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  34.95 
 
 		 836 aa  422  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 831 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 816 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  34.54 
 
 		 799 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  38.32 
 
 		 713 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  38.22 
 
 		 720 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 817 aa  406  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  37.34 
 
 		 722 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  35.26 
 
 		 841 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 		 802 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  33.45 
 
 		 841 aa  399  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  35.69 
 
 		 803 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 		 727 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  37.78 
 
 		 752 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 		 745 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 		 703 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  37.48 
 
 		 747 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 		 738 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 		 738 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 822 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  37.63 
 
 		 719 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  37.03 
 
 		 724 aa  389  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  37.63 
 
 		 719 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 		 822 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  32.69 
 
 		 808 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.92 
 
 		 812 aa  379  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  33.37 
 
 		 801 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 795 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 		 798 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  31.99 
 
 		 807 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  34.7 
 
 		 803 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 748 aa  360  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  34.51 
 
 		 778 aa  354  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 723 aa  349  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  33.75 
 
 		 827 aa  349  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 833 aa  344  4e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  33.81 
 
 		 720 aa  336  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  32.12 
 
 		 744 aa  333  6e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 		 741 aa  333  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 741 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  33.33 
 
 		 753 aa  327  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 787 aa  326  8.000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 747 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 		 747 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  33.38 
 
 		 766 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 753 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 724 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 725 aa  317  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 737 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 		 840 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 693 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 693 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 696 aa  313  9e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 725 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 		 725 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 724 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 732 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 714 aa  304  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 737 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 730 aa  303  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 737 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.91 
 
 		 728 aa  303  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 741 aa  303  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 		 735 aa  301  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 737 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  33.28 
 
 		 700 aa  300  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 		 765 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 		 765 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.54 
 
 		 724 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.68 
 
 		 724 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  32.44 
 
 		 699 aa  298  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>