More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3276 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
840 aa  1706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  43.84 
 
 
714 aa  569  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  45.07 
 
 
766 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  37.9 
 
 
814 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  40.03 
 
 
728 aa  528  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  40.78 
 
 
747 aa  528  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  39.97 
 
 
731 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  40.03 
 
 
729 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  41.46 
 
 
803 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  41.96 
 
 
735 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  37.94 
 
 
815 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  41.73 
 
 
732 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  41.87 
 
 
723 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  39.86 
 
 
723 aa  512  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  39.39 
 
 
724 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  39.39 
 
 
724 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  40.06 
 
 
722 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  38.58 
 
 
729 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  38.58 
 
 
729 aa  505  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  38.2 
 
 
816 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  38.58 
 
 
729 aa  505  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  38.58 
 
 
729 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  39.24 
 
 
724 aa  506  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  38.58 
 
 
729 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  39.1 
 
 
724 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  37.93 
 
 
802 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  39.1 
 
 
724 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  38.67 
 
 
733 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  38.58 
 
 
729 aa  505  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  38.58 
 
 
729 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  38.44 
 
 
729 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  39.66 
 
 
722 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  38.3 
 
 
729 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  40.35 
 
 
722 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  41.53 
 
 
723 aa  495  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  36.82 
 
 
812 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  34.83 
 
 
808 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  36.45 
 
 
807 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  40.38 
 
 
827 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  35.84 
 
 
806 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  39.97 
 
 
741 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  39.76 
 
 
747 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 
803 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  36.59 
 
 
799 aa  472  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  38.81 
 
 
696 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  39.67 
 
 
741 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  39.05 
 
 
737 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  39.61 
 
 
747 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  39.61 
 
 
693 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 
795 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  39.61 
 
 
693 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  38.71 
 
 
753 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  38.89 
 
 
753 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  40.42 
 
 
700 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  35.8 
 
 
801 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  39.97 
 
 
737 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  38.37 
 
 
741 aa  452  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  39.67 
 
 
737 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  39.67 
 
 
737 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 
798 aa  449  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 
824 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.29 
 
 
789 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  36.6 
 
 
721 aa  442  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  33.21 
 
 
817 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 
819 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  38.31 
 
 
699 aa  436  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  36.1 
 
 
810 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  37.67 
 
 
748 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  39.6 
 
 
740 aa  432  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  36.65 
 
 
802 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 
833 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  37.22 
 
 
841 aa  419  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.16 
 
 
812 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 
822 aa  409  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  34.8 
 
 
720 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  35.73 
 
 
730 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 
825 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 
840 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  37.97 
 
 
722 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 
826 aa  396  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 
822 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 
723 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 
831 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  35.7 
 
 
821 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  35.89 
 
 
716 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  37.09 
 
 
722 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  34.89 
 
 
725 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  36.26 
 
 
717 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 
836 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 
726 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  35.27 
 
 
707 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 
828 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 
728 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 
728 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 
828 aa  364  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 
841 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 
728 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 
844 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 
718 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 
703 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>