More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  53.13 
 
 
778 aa  691    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  48.43 
 
 
714 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  59.97 
 
 
796 aa  924    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  48.29 
 
 
714 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  54.2 
 
 
882 aa  823    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  51.25 
 
 
827 aa  790    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  53.92 
 
 
921 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  57.44 
 
 
679 aa  799    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  60.53 
 
 
796 aa  930    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  59.9 
 
 
796 aa  922    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  49.85 
 
 
677 aa  648    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  53.67 
 
 
881 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  52.02 
 
 
766 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  59.77 
 
 
809 aa  981    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  52.58 
 
 
858 aa  821    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  53.92 
 
 
921 aa  837    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  53.67 
 
 
881 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  56.71 
 
 
742 aa  805    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  53.29 
 
 
781 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  52.75 
 
 
863 aa  826    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  51.11 
 
 
708 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  51.73 
 
 
821 aa  780    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  52.7 
 
 
855 aa  806    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  52.15 
 
 
719 aa  662    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  53.92 
 
 
881 aa  836    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  67.96 
 
 
795 aa  1009    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
810 aa  1645    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  52.7 
 
 
855 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  50.72 
 
 
721 aa  675    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  67.23 
 
 
795 aa  1019    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  60.54 
 
 
796 aa  924    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  50.37 
 
 
707 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  47.99 
 
 
724 aa  625  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  43.7 
 
 
713 aa  596  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  43.7 
 
 
713 aa  594  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  44.49 
 
 
713 aa  584  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  45.85 
 
 
709 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  44.03 
 
 
726 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  42.24 
 
 
706 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  41.65 
 
 
705 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  42.81 
 
 
725 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  42.73 
 
 
725 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  42.33 
 
 
722 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  42.27 
 
 
722 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  42.27 
 
 
722 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  41.2 
 
 
731 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  38.67 
 
 
793 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  43.81 
 
 
582 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  37.54 
 
 
706 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 
712 aa  296  7e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  32.74 
 
 
701 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  33.48 
 
 
708 aa  290  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  33.53 
 
 
703 aa  287  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 
722 aa  286  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 
757 aa  285  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 
710 aa  282  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 
708 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
692 aa  279  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 
703 aa  277  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.35 
 
 
703 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 
701 aa  270  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 
709 aa  268  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  32.31 
 
 
703 aa  267  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.51 
 
 
696 aa  267  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 
722 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  33.53 
 
 
689 aa  265  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 
696 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.36 
 
 
711 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
702 aa  260  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
702 aa  260  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 
710 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 
711 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 
778 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 
714 aa  250  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 
815 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  30.57 
 
 
709 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 
741 aa  249  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 
732 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 
723 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 
792 aa  247  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 
701 aa  247  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 
734 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 
701 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 
736 aa  245  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 
701 aa  242  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 
724 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 
724 aa  241  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 
708 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
726 aa  239  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 
794 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 
701 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 
828 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 
860 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 
797 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 
726 aa  235  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 
743 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.58 
 
 
806 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 
850 aa  233  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 
707 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 
825 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>