More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2239 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  97.77 
 
 		 726 aa  1116    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 582 aa  1169    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  48.9 
 
 		 709 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  45.74 
 
 		 713 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  43.59 
 
 		 707 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  44.63 
 
 		 724 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  46.01 
 
 		 713 aa  465  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  46.01 
 
 		 713 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  44.91 
 
 		 795 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  44.55 
 
 		 795 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  43.81 
 
 		 810 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  42.34 
 
 		 721 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  44.25 
 
 		 719 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  41.12 
 
 		 714 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  42.36 
 
 		 809 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  41.12 
 
 		 677 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  41.12 
 
 		 714 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  43.49 
 
 		 708 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  42.29 
 
 		 742 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 		 796 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.75 
 
 		 706 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  42.64 
 
 		 679 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  42.4 
 
 		 881 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  42.59 
 
 		 882 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  42.4 
 
 		 881 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  42.59 
 
 		 921 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  41.67 
 
 		 863 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  42.59 
 
 		 921 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  42.59 
 
 		 881 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  43.45 
 
 		 796 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  43.66 
 
 		 796 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  43.45 
 
 		 796 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  41.42 
 
 		 858 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  40.24 
 
 		 705 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  44.06 
 
 		 821 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  43.95 
 
 		 781 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  41.06 
 
 		 855 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  41.06 
 
 		 855 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 		 827 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  42.62 
 
 		 778 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  41.86 
 
 		 766 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  39.89 
 
 		 725 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  40.04 
 
 		 725 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  39.89 
 
 		 722 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  39.51 
 
 		 722 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  39.51 
 
 		 722 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  37.84 
 
 		 793 aa  346  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  39.32 
 
 		 731 aa  345  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  35.33 
 
 		 706 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 712 aa  249  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  35.51 
 
 		 741 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 714 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 732 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  32.72 
 
 		 726 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  33.02 
 
 		 815 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  34.46 
 
 		 715 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  33.39 
 
 		 726 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 722 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 722 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 708 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 738 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 743 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 825 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 825 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 736 aa  216  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.54 
 
 		 711 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 		 757 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 701 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.45 
 
 		 817 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 860 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 689 aa  212  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 726 aa  210  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  33.94 
 
 		 689 aa  209  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 703 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.58 
 
 		 703 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.91 
 
 		 710 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 701 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 734 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 710 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 710 aa  204  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 701 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 722 aa  203  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 		 837 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 		 701 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  31.61 
 
 		 703 aa  200  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 730 aa  197  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.43 
 
 		 862 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 743 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 702 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 702 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 692 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 		 701 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  31.37 
 
 		 708 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.15 
 
 		 709 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.55 
 
 		 696 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.98 
 
 		 850 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 711 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 708 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 706 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 706 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>