More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5875 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  77.54 
 
 		 734 aa  1072    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  62.94 
 
 		 689 aa  853    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  75.65 
 
 		 732 aa  1041    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  77.44 
 
 		 736 aa  1054    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  75.25 
 
 		 714 aa  1024    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 689 aa  1366    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  82.61 
 
 		 738 aa  1139    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  46.2 
 
 		 708 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  45.9 
 
 		 703 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  43.67 
 
 		 696 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  44.48 
 
 		 703 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  43.72 
 
 		 703 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  42.99 
 
 		 692 aa  535  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  43.5 
 
 		 696 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  42.88 
 
 		 701 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  42.11 
 
 		 709 aa  515  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  41.37 
 
 		 708 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  45.3 
 
 		 741 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  43.15 
 
 		 722 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  40.27 
 
 		 708 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  45.08 
 
 		 730 aa  492  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 715 aa  489  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  39.22 
 
 		 711 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  40.06 
 
 		 709 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  42.43 
 
 		 710 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  41.37 
 
 		 711 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  41.53 
 
 		 710 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  41.12 
 
 		 701 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  42.24 
 
 		 689 aa  452  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  41.84 
 
 		 703 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  41.05 
 
 		 701 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  40.6 
 
 		 701 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  41.09 
 
 		 701 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  41.47 
 
 		 701 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  41.47 
 
 		 701 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  38.52 
 
 		 757 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  40.62 
 
 		 722 aa  435  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  40.23 
 
 		 722 aa  422  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 		 712 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 		 710 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 		 701 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 		 724 aa  360  7e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 724 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 702 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 702 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 864 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 860 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 723 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  33.28 
 
 		 715 aa  351  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 		 817 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.73 
 
 		 713 aa  343  8e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 		 843 aa  342  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 		 720 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 714 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 720 aa  340  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 862 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 720 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 		 720 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  36.08 
 
 		 837 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 726 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 726 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 		 720 aa  325  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  34.79 
 
 		 850 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 726 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 		 815 aa  321  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 743 aa  320  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 707 aa  319  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 825 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 825 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  32.53 
 
 		 699 aa  297  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 821 aa  294  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 829 aa  292  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 859 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 829 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 720 aa  283  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 		 819 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 799 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 796 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 796 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  31.18 
 
 		 707 aa  271  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 707 aa  269  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 770 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 767 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 710 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 796 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 795 aa  266  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 710 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 745 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 796 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 		 726 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 795 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.88 
 
 		 724 aa  259  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 713 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  30.91 
 
 		 730 aa  257  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 698 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 721 aa  250  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 708 aa  249  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 753 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 689 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.58 
 
 		 797 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>