More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1016 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  73.75 
 
 		 719 aa  1026    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  48.86 
 
 		 713 aa  667    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  51.04 
 
 		 796 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 707 aa  1458    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  69.7 
 
 		 714 aa  984    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  69.7 
 
 		 677 aa  982    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  49.21 
 
 		 713 aa  672    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  69.76 
 
 		 721 aa  1048    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  52.27 
 
 		 709 aa  696    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  49.48 
 
 		 809 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  48.21 
 
 		 858 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  48.15 
 
 		 863 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  48.51 
 
 		 742 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  50.37 
 
 		 810 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  51.34 
 
 		 796 aa  681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  71.67 
 
 		 708 aa  1031    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  69.55 
 
 		 714 aa  981    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  50.6 
 
 		 796 aa  673    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  52.75 
 
 		 795 aa  703    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  51.03 
 
 		 724 aa  682    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  52.75 
 
 		 795 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  49.85 
 
 		 713 aa  674    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  50.45 
 
 		 796 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  47.14 
 
 		 882 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  47 
 
 		 921 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  47 
 
 		 881 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  47 
 
 		 881 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  47 
 
 		 921 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  47 
 
 		 881 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  47.06 
 
 		 679 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  47.7 
 
 		 855 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  47.7 
 
 		 855 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  45.26 
 
 		 827 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  47.92 
 
 		 766 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  48.74 
 
 		 778 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  47.23 
 
 		 821 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  46.8 
 
 		 781 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  45.52 
 
 		 726 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  43.37 
 
 		 706 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  41.98 
 
 		 725 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  41.94 
 
 		 705 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  40.87 
 
 		 731 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  41.98 
 
 		 725 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  42.58 
 
 		 722 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  42.58 
 
 		 722 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  41 
 
 		 722 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  44.69 
 
 		 582 aa  465  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  40.42 
 
 		 793 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  36.77 
 
 		 706 aa  409  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  33.29 
 
 		 708 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  32.64 
 
 		 703 aa  312  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 710 aa  310  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  35.05 
 
 		 815 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 712 aa  302  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 708 aa  300  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  34.08 
 
 		 689 aa  300  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  33.23 
 
 		 696 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 696 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 743 aa  291  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 701 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.49 
 
 		 703 aa  287  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 703 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 692 aa  281  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 702 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 702 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 714 aa  277  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 722 aa  276  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.04 
 
 		 709 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.61 
 
 		 711 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 734 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 701 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 709 aa  274  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 710 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 732 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 708 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 724 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 736 aa  265  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 723 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 724 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 757 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 722 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 710 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 860 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 701 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 714 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 		 720 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 701 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 701 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 		 720 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  31.77 
 
 		 738 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 715 aa  252  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 689 aa  252  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 701 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 689 aa  252  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 837 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 		 720 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 720 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 711 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 701 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 701 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>