More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0010 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  58.07 
 
 		 862 aa  949    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  55.35 
 
 		 843 aa  904    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  52.64 
 
 		 850 aa  832    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  48.76 
 
 		 859 aa  785    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 864 aa  1745    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  44.43 
 
 		 817 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  38.69 
 
 		 837 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 		 860 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  38.29 
 
 		 815 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  38.47 
 
 		 825 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  38.32 
 
 		 825 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 734 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  34.69 
 
 		 708 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  34.73 
 
 		 703 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 		 736 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 738 aa  364  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 		 689 aa  360  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  35.02 
 
 		 714 aa  360  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 		 732 aa  357  5e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 		 711 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 709 aa  354  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  32.66 
 
 		 689 aa  353  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 		 708 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 		 741 aa  350  9e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  33.74 
 
 		 696 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 708 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  34.54 
 
 		 712 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  35.46 
 
 		 722 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 692 aa  340  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 743 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 726 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  33.13 
 
 		 696 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  35.49 
 
 		 730 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.28 
 
 		 703 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 		 726 aa  335  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  35.33 
 
 		 715 aa  333  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 701 aa  331  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  34.02 
 
 		 709 aa  331  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 		 710 aa  330  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 703 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 819 aa  327  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  33.92 
 
 		 689 aa  325  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  35 
 
 		 726 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 710 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 701 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.68 
 
 		 711 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 701 aa  310  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 701 aa  307  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 701 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 821 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 701 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 		 792 aa  305  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 701 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 701 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 710 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 793 aa  303  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 757 aa  302  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 722 aa  300  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  31.77 
 
 		 722 aa  299  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  32.8 
 
 		 703 aa  296  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 713 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 807 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 		 829 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 812 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 789 aa  286  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 724 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 829 aa  283  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 707 aa  281  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 724 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 		 723 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  31.01 
 
 		 716 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  31.67 
 
 		 695 aa  271  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 771 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 715 aa  269  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  30.5 
 
 		 799 aa  267  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 771 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 714 aa  267  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 719 aa  267  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 715 aa  267  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 781 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 723 aa  266  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 		 817 aa  266  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 757 aa  266  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 828 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 709 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 694 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.12 
 
 		 713 aa  263  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 		 720 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 720 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 706 aa  262  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 706 aa  262  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 720 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 828 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 766 aa  261  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  27.86 
 
 		 729 aa  261  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 		 769 aa  260  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 701 aa  260  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 828 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 791 aa  258  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 720 aa  257  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>