More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2387 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  45.71 
 
 
722 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
712 aa  1473    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  45.67 
 
 
757 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  46.06 
 
 
722 aa  601  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  44.57 
 
 
701 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  46.22 
 
 
710 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  45.24 
 
 
689 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  42.5 
 
 
703 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 
701 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 
701 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  42.62 
 
 
701 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  42.19 
 
 
701 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  42.54 
 
 
701 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  42.05 
 
 
701 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  41.59 
 
 
702 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  41.59 
 
 
702 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  38.31 
 
 
713 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  40.11 
 
 
708 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  39.08 
 
 
703 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 
709 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  38.77 
 
 
724 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  38.17 
 
 
723 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  38.76 
 
 
692 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  38.62 
 
 
724 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  38.57 
 
 
715 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  38.71 
 
 
714 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 
701 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  38.19 
 
 
696 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  37.89 
 
 
696 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  36.57 
 
 
703 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  37.78 
 
 
720 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  37.63 
 
 
720 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  37.39 
 
 
720 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  37.48 
 
 
720 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.73 
 
 
703 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  38.8 
 
 
710 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  38.2 
 
 
699 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  35.21 
 
 
707 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  37.58 
 
 
736 aa  425  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 
720 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  37.39 
 
 
734 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  37.08 
 
 
732 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  38.7 
 
 
741 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  36.98 
 
 
714 aa  412  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  36.63 
 
 
708 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 
689 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 
738 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 
720 aa  399  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 
710 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  35.43 
 
 
711 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  35.52 
 
 
708 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.44 
 
 
711 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  36.13 
 
 
709 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  36.68 
 
 
689 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 
722 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  36.22 
 
 
715 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  36.91 
 
 
850 aa  360  7e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 
730 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  34.54 
 
 
864 aa  330  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 
705 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 
843 aa  323  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  34.29 
 
 
795 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  34.4 
 
 
817 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  32.77 
 
 
815 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 
721 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.91 
 
 
706 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  34.29 
 
 
795 aa  317  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 
859 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 
862 aa  313  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 
707 aa  313  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 
810 aa  312  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 
837 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
825 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 
863 aa  302  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 
825 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 
860 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 
714 aa  300  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 
858 aa  300  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 
714 aa  300  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 
677 aa  299  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 
796 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 
796 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 
709 aa  296  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 
855 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 
796 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 
855 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 
708 aa  293  9e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 
809 aa  293  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 
742 aa  291  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 
796 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 
726 aa  290  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.63 
 
 
724 aa  286  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 
719 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 
882 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 
881 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 
881 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 
921 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 
921 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 
881 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 
679 aa  280  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>