More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01528 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 720 aa  1482    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  46.89 
 
 		 702 aa  658    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  46.89 
 
 		 702 aa  658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  44.78 
 
 		 724 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  43.76 
 
 		 723 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  44.49 
 
 		 724 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  43.93 
 
 		 715 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  44.01 
 
 		 720 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  44.38 
 
 		 714 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  43.44 
 
 		 720 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  43.3 
 
 		 720 aa  592  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  43.44 
 
 		 720 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  38.81 
 
 		 720 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  35.82 
 
 		 707 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  37.08 
 
 		 699 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.25 
 
 		 713 aa  419  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  36.73 
 
 		 689 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  36.13 
 
 		 701 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  35.95 
 
 		 701 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 		 757 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  36.13 
 
 		 701 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  34.46 
 
 		 712 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 722 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  34.32 
 
 		 701 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 		 701 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  34.32 
 
 		 701 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  35.74 
 
 		 703 aa  395  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  34.37 
 
 		 722 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 710 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  32.2 
 
 		 708 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.56 
 
 		 703 aa  350  7e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  31.06 
 
 		 703 aa  343  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 701 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.48 
 
 		 696 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 703 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 696 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 701 aa  330  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 709 aa  327  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 708 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.22 
 
 		 709 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 692 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 708 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 711 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 710 aa  300  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 710 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.88 
 
 		 711 aa  296  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 741 aa  280  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 722 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 730 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 734 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 689 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 715 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 736 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 732 aa  251  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 714 aa  250  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 815 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 689 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 		 850 aa  238  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 738 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 707 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 825 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 825 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 721 aa  230  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 796 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 714 aa  213  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 714 aa  213  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 677 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.22 
 
 		 713 aa  211  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.81 
 
 		 713 aa  211  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 713 aa  210  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 706 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 706 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 862 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.16 
 
 		 724 aa  208  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  26.88 
 
 		 716 aa  208  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 719 aa  207  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 796 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 796 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 742 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 770 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 796 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 742 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 792 aa  203  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 710 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  27.12 
 
 		 711 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 795 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 743 aa  201  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 738 aa  201  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 837 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 795 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 713 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 700 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 711 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 708 aa  197  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 709 aa  197  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 710 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  27.33 
 
 		 695 aa  196  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 817 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.95 
 
 		 833 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.96 
 
 		 706 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>