More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0218 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  54.18 
 
 
862 aa  813    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  50.61 
 
 
843 aa  764    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  64.94 
 
 
850 aa  1100    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
859 aa  1746    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  48.76 
 
 
864 aa  762    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 
817 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 
860 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  36.69 
 
 
837 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  39.05 
 
 
815 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  37.75 
 
 
825 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  37.62 
 
 
825 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 
711 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 
708 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 
726 aa  333  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.59 
 
 
709 aa  333  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  35.49 
 
 
726 aa  333  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 
708 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  36.32 
 
 
743 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 
741 aa  324  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  34.69 
 
 
715 aa  320  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
701 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  34.79 
 
 
712 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 
734 aa  312  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.97 
 
 
703 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  33.18 
 
 
703 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  33.18 
 
 
757 aa  308  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  33.54 
 
 
696 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 
692 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  33.39 
 
 
696 aa  303  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 
722 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 
726 aa  300  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
689 aa  299  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  31.87 
 
 
708 aa  298  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  32.65 
 
 
703 aa  297  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 
709 aa  297  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 
710 aa  296  9e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 
722 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 
730 aa  294  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  33.13 
 
 
738 aa  294  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 
710 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 
736 aa  293  9e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.96 
 
 
711 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  34.52 
 
 
689 aa  287  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 
722 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 
689 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 
701 aa  282  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 
732 aa  282  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 
713 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 
829 aa  279  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 
792 aa  278  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 
714 aa  277  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 
724 aa  277  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 
701 aa  277  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 
723 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  33.07 
 
 
710 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 
807 aa  272  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 
701 aa  271  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 
724 aa  270  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 
819 aa  266  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 
701 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 
789 aa  265  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 
721 aa  262  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 
821 aa  262  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 
701 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 
701 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 
701 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 
793 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  29.9 
 
 
799 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 
805 aa  258  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 
715 aa  256  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 
706 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 
706 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 
812 aa  253  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  32.63 
 
 
703 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 
799 aa  253  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 
770 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 
730 aa  252  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
797 aa  251  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 
720 aa  251  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 
710 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 
809 aa  250  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 
714 aa  250  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 
814 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 
720 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 
720 aa  247  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 
710 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 
720 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 
757 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 
702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 
702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 
817 aa  245  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 
698 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 
726 aa  244  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  30.2 
 
 
801 aa  244  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  29.31 
 
 
695 aa  243  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 
719 aa  243  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 
709 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 
707 aa  243  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 
699 aa  242  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 
769 aa  241  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>