More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2239 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 789 aa  1608    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 814 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 824 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 		 837 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 850 aa  278  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 864 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 860 aa  270  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 		 862 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 807 aa  266  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 781 aa  258  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 859 aa  258  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 766 aa  253  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 817 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 812 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 791 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 815 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 809 aa  241  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 776 aa  240  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 810 aa  237  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 795 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 709 aa  236  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.43 
 
 		 709 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 825 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 793 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 825 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 843 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  28.59 
 
 		 708 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 785 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  28.59 
 
 		 703 aa  231  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 806 aa  231  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 711 aa  230  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 708 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 810 aa  227  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 708 aa  227  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 782 aa  227  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 738 aa  223  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 713 aa  223  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 767 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 711 aa  221  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 742 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 742 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 710 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 786 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 794 aa  218  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 740 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 809 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 799 aa  215  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 805 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 714 aa  215  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 749 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 723 aa  213  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 786 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 742 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 748 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 748 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 712 aa  210  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 737 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.35 
 
 		 696 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 907 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 789 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 741 aa  207  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 710 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 696 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 743 aa  206  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01148  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.41 
 
 		 708 aa  204  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 723 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  27.12 
 
 		 716 aa  203  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 719 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.86 
 
 		 711 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 858 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 715 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 734 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 730 aa  200  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 710 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 819 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 769 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 770 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 703 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 755 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 712 aa  197  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 692 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 863 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.61 
 
 		 801 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.43 
 
 		 703 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 792 aa  196  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 722 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 710 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 723 aa  195  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  28.38 
 
 		 689 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 727 aa  194  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 689 aa  194  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 855 aa  194  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 701 aa  194  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 855 aa  194  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 707 aa  193  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 726 aa  193  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 821 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 713 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 797 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 726 aa  191  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>