More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4103 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  58.41 
 
 		 709 aa  822    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  58.22 
 
 		 711 aa  823    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  59.08 
 
 		 710 aa  831    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  59.3 
 
 		 708 aa  858    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  59.11 
 
 		 711 aa  858    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 710 aa  1449    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  59.61 
 
 		 708 aa  862    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  44.82 
 
 		 708 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  44.95 
 
 		 703 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  46.29 
 
 		 701 aa  594  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  46.65 
 
 		 696 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  46.5 
 
 		 696 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  47.17 
 
 		 703 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  46.22 
 
 		 703 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  46.48 
 
 		 722 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  46.93 
 
 		 741 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  45.88 
 
 		 709 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  45.77 
 
 		 692 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  46.53 
 
 		 715 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  46.69 
 
 		 730 aa  558  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  42.05 
 
 		 734 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  43.09 
 
 		 714 aa  498  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  43.34 
 
 		 736 aa  498  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  43.34 
 
 		 732 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  42.43 
 
 		 689 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  41.06 
 
 		 738 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  38.18 
 
 		 701 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  40.15 
 
 		 710 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  40.77 
 
 		 689 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  38.8 
 
 		 712 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  39.28 
 
 		 689 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  37.36 
 
 		 722 aa  429  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  37.46 
 
 		 701 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  38.63 
 
 		 722 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  37.32 
 
 		 701 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  36.26 
 
 		 757 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  36.67 
 
 		 701 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  37.6 
 
 		 703 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  37.28 
 
 		 701 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  37.14 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  37.14 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  37.07 
 
 		 860 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 724 aa  359  8e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.1 
 
 		 713 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 723 aa  357  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 743 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 		 724 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 726 aa  350  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 726 aa  350  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 715 aa  349  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 		 702 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 		 702 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 714 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 850 aa  343  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  31.97 
 
 		 720 aa  339  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 720 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 720 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 720 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 720 aa  330  7e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 837 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 799 aa  322  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  32.07 
 
 		 707 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 		 726 aa  321  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 825 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 825 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 843 aa  319  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 862 aa  313  9e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  32.1 
 
 		 699 aa  312  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 864 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 720 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  36.11 
 
 		 796 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 815 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 		 796 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 		 796 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  35.39 
 
 		 796 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 770 aa  290  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 710 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 727 aa  286  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 		 817 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 859 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 795 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 710 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 795 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 708 aa  280  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.04 
 
 		 806 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 707 aa  277  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 721 aa  276  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  31.12 
 
 		 701 aa  275  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 		 821 aa  274  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 705 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  30.53 
 
 		 799 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.25 
 
 		 706 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.1 
 
 		 833 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.9 
 
 		 797 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  32.35 
 
 		 801 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.56 
 
 		 724 aa  267  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  30.31 
 
 		 713 aa  267  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 707 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.81 
 
 		 713 aa  265  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 817 aa  264  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>