More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3980 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 719 aa  1466    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  51.14 
 
 		 792 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  50.14 
 
 		 707 aa  635  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  48.87 
 
 		 694 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  48.45 
 
 		 715 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  45.45 
 
 		 710 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  45.73 
 
 		 770 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  45 
 
 		 710 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  43.93 
 
 		 706 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  43.93 
 
 		 706 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  44.96 
 
 		 695 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  40.52 
 
 		 757 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  40.52 
 
 		 709 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 		 727 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 		 745 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 753 aa  343  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 732 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 755 aa  336  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 732 aa  335  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 		 742 aa  328  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 		 742 aa  328  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 700 aa  326  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 734 aa  323  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 751 aa  319  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 705 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 724 aa  319  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  31.73 
 
 		 753 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 		 719 aa  317  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 734 aa  317  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 724 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 766 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 		 736 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 		 731 aa  312  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 707 aa  311  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 		 689 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  34.96 
 
 		 756 aa  306  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 689 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 771 aa  303  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 755 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  33.75 
 
 		 698 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 733 aa  295  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 		 735 aa  293  7e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1569  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 767 aa  290  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.428413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 		 749 aa  287  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 720 aa  286  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 		 709 aa  286  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 712 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 		 747 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 821 aa  283  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 		 656 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  32.12 
 
 		 765 aa  280  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 722 aa  280  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 759 aa  280  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  31.65 
 
 		 680 aa  279  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 759 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 		 817 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 733 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 850 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 732 aa  276  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 740 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 		 767 aa  273  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 860 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 769 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  33.02 
 
 		 760 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 862 aa  267  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 737 aa  267  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 777 aa  266  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 780 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 753 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  29.82 
 
 		 708 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  30.23 
 
 		 703 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 747 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 747 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 760 aa  261  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 747 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 747 aa  260  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 		 768 aa  260  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 776 aa  259  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 692 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 748 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 749 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 		 741 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 734 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 747 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 763 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 748 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  31.24 
 
 		 748 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  31.28 
 
 		 772 aa  256  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 748 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 762 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 747 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 773 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 815 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 843 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 693 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 864 aa  254  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 739 aa  253  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  27.94 
 
 		 743 aa  252  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 696 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  31.61 
 
 		 733 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>