More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3999 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  48.28 
 
 		 707 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  54.33 
 
 		 796 aa  852    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  63.94 
 
 		 921 aa  1030    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  55.3 
 
 		 796 aa  858    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  56.78 
 
 		 778 aa  757    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  66.82 
 
 		 679 aa  961    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  58.66 
 
 		 766 aa  787    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  51.73 
 
 		 810 aa  819    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  63.94 
 
 		 881 aa  1028    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  64.04 
 
 		 882 aa  1019    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  52.28 
 
 		 809 aa  848    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  63.41 
 
 		 858 aa  1052    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  63.94 
 
 		 881 aa  1028    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  65.09 
 
 		 863 aa  1060    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  66.67 
 
 		 742 aa  1014    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  58 
 
 		 781 aa  778    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  55.82 
 
 		 795 aa  849    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 821 aa  1675    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  65.42 
 
 		 855 aa  1050    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  58.69 
 
 		 827 aa  941    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  54.71 
 
 		 796 aa  856    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  63.94 
 
 		 921 aa  1030    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  55.76 
 
 		 795 aa  844    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  65.42 
 
 		 855 aa  1050    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  54.66 
 
 		 796 aa  856    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  63.94 
 
 		 881 aa  1028    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  44.92 
 
 		 721 aa  608  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  46.65 
 
 		 719 aa  602  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  45.28 
 
 		 708 aa  596  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  44.01 
 
 		 714 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  44.73 
 
 		 677 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  43.87 
 
 		 714 aa  592  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  43.14 
 
 		 713 aa  579  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  43.14 
 
 		 713 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  43.47 
 
 		 724 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  43.49 
 
 		 713 aa  557  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  44.49 
 
 		 726 aa  528  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  42.62 
 
 		 709 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.06 
 
 		 706 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  41.41 
 
 		 725 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  39.19 
 
 		 705 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  41.56 
 
 		 731 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  41.56 
 
 		 725 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  41.35 
 
 		 722 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  41.27 
 
 		 722 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  41.35 
 
 		 722 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  35.59 
 
 		 793 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  44.06 
 
 		 582 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  35.46 
 
 		 706 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 714 aa  280  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 712 aa  278  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 732 aa  277  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.9 
 
 		 708 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 736 aa  269  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  30.58 
 
 		 703 aa  266  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 710 aa  265  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  32.87 
 
 		 689 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 701 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 708 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 702 aa  261  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 702 aa  261  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 703 aa  260  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 709 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 734 aa  259  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 738 aa  257  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.8 
 
 		 711 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 722 aa  249  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.07 
 
 		 703 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 797 aa  247  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.23 
 
 		 696 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  31.1 
 
 		 703 aa  246  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 692 aa  245  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 701 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 743 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 708 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 757 aa  243  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 701 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 696 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 		 689 aa  239  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 850 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 710 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 741 aa  238  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 701 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 		 715 aa  238  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 825 aa  237  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 723 aa  237  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 825 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 817 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 815 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.89 
 
 		 709 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 860 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 701 aa  232  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 701 aa  232  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 828 aa  231  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 792 aa  230  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 689 aa  230  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 		 726 aa  229  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 722 aa  228  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>