More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3324 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  87.66 
 
 		 713 aa  1276    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  51.6 
 
 		 709 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  100 
 
 		 713 aa  1468    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  49.85 
 
 		 707 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  57.33 
 
 		 724 aa  824    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  98.88 
 
 		 713 aa  1457    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  48.16 
 
 		 719 aa  626  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  48.31 
 
 		 708 aa  624  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  46.32 
 
 		 721 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  45.33 
 
 		 677 aa  608  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  45.33 
 
 		 714 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  45.33 
 
 		 714 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  45.55 
 
 		 809 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  44.43 
 
 		 795 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  43.7 
 
 		 810 aa  595  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  45.36 
 
 		 863 aa  594  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  43.87 
 
 		 795 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  44.83 
 
 		 796 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  45.1 
 
 		 796 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  44.95 
 
 		 796 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  45.83 
 
 		 858 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  44.8 
 
 		 855 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  44.51 
 
 		 796 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  44.8 
 
 		 855 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  44.31 
 
 		 742 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  45.75 
 
 		 766 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  43.39 
 
 		 921 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  43.39 
 
 		 881 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  43.39 
 
 		 881 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  43.39 
 
 		 881 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  43.39 
 
 		 921 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  43.54 
 
 		 882 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  43.39 
 
 		 679 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  42.58 
 
 		 821 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  44.1 
 
 		 726 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  43.53 
 
 		 827 aa  547  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  44.9 
 
 		 781 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  44.77 
 
 		 778 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  42.57 
 
 		 725 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  42.12 
 
 		 722 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  42.71 
 
 		 722 aa  512  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  42.71 
 
 		 722 aa  512  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  42.57 
 
 		 725 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  42.26 
 
 		 731 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.6 
 
 		 706 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 705 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  46.01 
 
 		 582 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  37.23 
 
 		 706 aa  405  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 793 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  31.67 
 
 		 689 aa  287  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.23 
 
 		 708 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 		 722 aa  277  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 703 aa  276  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 709 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 757 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  29.93 
 
 		 703 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 712 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 722 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 696 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.77 
 
 		 703 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.56 
 
 		 696 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 692 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 701 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 734 aa  258  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 710 aa  257  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 815 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 715 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 710 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 708 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 710 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 701 aa  252  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 724 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 723 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 708 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 724 aa  250  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  30.63 
 
 		 709 aa  250  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 732 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.19 
 
 		 711 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 860 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 714 aa  244  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  29.63 
 
 		 703 aa  242  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 726 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 726 aa  241  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 702 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 702 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 711 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 743 aa  236  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 723 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  29.51 
 
 		 716 aa  234  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 743 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 738 aa  234  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 736 aa  232  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 		 850 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 720 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  32.2 
 
 		 718 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 689 aa  228  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 825 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 720 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 701 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>