More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0688 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  70.99 
 
 		 723 aa  1095    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  100 
 
 		 716 aa  1466    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 860 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 850 aa  266  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 825 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 864 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  29.92 
 
 		 703 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 		 825 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.24 
 
 		 708 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 721 aa  251  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 817 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 		 700 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 837 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 714 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 677 aa  242  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 714 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.14 
 
 		 696 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 696 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 815 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 796 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 862 aa  237  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.51 
 
 		 713 aa  234  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 796 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 703 aa  234  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 843 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  29.23 
 
 		 713 aa  233  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 796 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 796 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.8 
 
 		 703 aa  231  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 719 aa  230  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 712 aa  230  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  29.88 
 
 		 689 aa  230  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 707 aa  229  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 709 aa  229  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 711 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 710 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 722 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 859 aa  227  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 701 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 		 827 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 713 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 734 aa  226  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 689 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 732 aa  224  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 701 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 726 aa  224  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.82 
 
 		 724 aa  224  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 708 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 714 aa  223  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 698 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 689 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 701 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 792 aa  222  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 726 aa  221  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 708 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 738 aa  221  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 710 aa  220  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 809 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.9 
 
 		 709 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 707 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 689 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 821 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 709 aa  218  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 736 aa  217  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 692 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 726 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 701 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 701 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 795 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 715 aa  213  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.88 
 
 		 706 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 757 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 701 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 706 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 743 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 706 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 718 aa  211  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 795 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 821 aa  210  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 810 aa  210  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 708 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 701 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 701 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 701 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 705 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 710 aa  208  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 722 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 726 aa  207  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 725 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 770 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.26 
 
 		 711 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 781 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 710 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.98 
 
 		 703 aa  205  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 710 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 743 aa  205  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.43 
 
 		 766 aa  204  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 689 aa  203  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  27.07 
 
 		 690 aa  203  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 736 aa  203  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>