More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4597 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  89.12 
 
 		 722 aa  1298    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  88.78 
 
 		 731 aa  1287    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  97.66 
 
 		 725 aa  1360    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  88.55 
 
 		 722 aa  1288    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 725 aa  1467    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  88.55 
 
 		 722 aa  1288    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  42.11 
 
 		 707 aa  539  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  44.18 
 
 		 795 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  42.39 
 
 		 713 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  44.32 
 
 		 795 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  42.82 
 
 		 713 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  42.42 
 
 		 713 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  42.09 
 
 		 721 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  41.94 
 
 		 708 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  43.69 
 
 		 719 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  41.92 
 
 		 714 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  42.07 
 
 		 714 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  42.07 
 
 		 677 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  42 
 
 		 709 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  43.82 
 
 		 778 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  42.01 
 
 		 724 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  41.95 
 
 		 863 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  41.87 
 
 		 781 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  42.81 
 
 		 810 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  42.01 
 
 		 858 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  41.25 
 
 		 796 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  40.86 
 
 		 796 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  42.16 
 
 		 855 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  42.16 
 
 		 855 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  41.04 
 
 		 796 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  41.04 
 
 		 796 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  41.03 
 
 		 706 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  41.7 
 
 		 742 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  39.4 
 
 		 766 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  41.54 
 
 		 881 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  41.54 
 
 		 679 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  41.54 
 
 		 921 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  41.54 
 
 		 881 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 827 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  41.54 
 
 		 882 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  41.54 
 
 		 921 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  41.54 
 
 		 881 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  40.06 
 
 		 705 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  40.53 
 
 		 726 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  38.07 
 
 		 809 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  40.39 
 
 		 821 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  37.66 
 
 		 793 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  39.89 
 
 		 582 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  34.99 
 
 		 706 aa  352  2e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  32.04 
 
 		 708 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  31.5 
 
 		 703 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 709 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.26 
 
 		 703 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 701 aa  267  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 703 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.12 
 
 		 696 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 696 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 722 aa  257  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 692 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  32.53 
 
 		 689 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 714 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 715 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 736 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 732 aa  244  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 		 707 aa  243  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 734 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 722 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 757 aa  241  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 860 aa  240  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 694 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 710 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 701 aa  238  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 708 aa  238  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 712 aa  237  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 815 aa  230  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 706 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 706 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 710 aa  227  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 710 aa  225  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  28.28 
 
 		 716 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.86 
 
 		 709 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 711 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 738 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 715 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.74 
 
 		 711 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 723 aa  220  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  29.58 
 
 		 703 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 724 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 689 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.43 
 
 		 701 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 723 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  30.51 
 
 		 695 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 741 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 		 743 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 		 715 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 724 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 720 aa  213  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 689 aa  213  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 792 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>