More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1057 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  79.83 
 
 		 721 aa  1200    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  50.07 
 
 		 796 aa  677    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  47.46 
 
 		 882 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  47.55 
 
 		 713 aa  657    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  50.37 
 
 		 796 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  50.45 
 
 		 809 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  68.63 
 
 		 677 aa  991    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  47.19 
 
 		 827 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  49.55 
 
 		 724 aa  653    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  52.1 
 
 		 795 aa  697    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  68.78 
 
 		 714 aa  993    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  47.13 
 
 		 713 aa  655    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  68.63 
 
 		 714 aa  991    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  52.15 
 
 		 810 aa  682    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  47.2 
 
 		 713 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  49.78 
 
 		 796 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  74.65 
 
 		 708 aa  1101    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  52.39 
 
 		 795 aa  698    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  50.95 
 
 		 709 aa  671    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  50.67 
 
 		 796 aa  680    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 719 aa  1474    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  71.41 
 
 		 707 aa  1070    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  47.31 
 
 		 881 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  47.31 
 
 		 881 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  47.31 
 
 		 881 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  47.31 
 
 		 921 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  47.31 
 
 		 921 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  47.69 
 
 		 679 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  47.1 
 
 		 742 aa  628  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  48.94 
 
 		 858 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  46.72 
 
 		 863 aa  623  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  48.03 
 
 		 855 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  48.03 
 
 		 855 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  47.58 
 
 		 781 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  47.92 
 
 		 766 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  47.78 
 
 		 778 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  45.48 
 
 		 821 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  44.89 
 
 		 726 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  43.67 
 
 		 706 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  42.88 
 
 		 705 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  42.46 
 
 		 725 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  43.05 
 
 		 731 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  41.33 
 
 		 722 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  41.33 
 
 		 722 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  42.11 
 
 		 722 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  42.19 
 
 		 725 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 793 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  44.25 
 
 		 582 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  34.94 
 
 		 706 aa  397  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  35.53 
 
 		 708 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  34.26 
 
 		 703 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  35.35 
 
 		 689 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 710 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 		 701 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 712 aa  299  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 815 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 		 708 aa  294  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  33.43 
 
 		 696 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 696 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 		 722 aa  287  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 		 703 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.59 
 
 		 703 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 692 aa  282  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 757 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.74 
 
 		 711 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.35 
 
 		 709 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 709 aa  279  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 710 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 722 aa  278  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 708 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 		 734 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 732 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 714 aa  270  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 701 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 701 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 711 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 		 837 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 		 860 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 		 701 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 		 736 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 724 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 701 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 743 aa  265  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 702 aa  264  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 702 aa  264  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 689 aa  261  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 		 724 aa  260  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  32.2 
 
 		 703 aa  259  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 701 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 715 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 701 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 701 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 850 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 710 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 738 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  30.48 
 
 		 716 aa  252  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.61 
 
 		 859 aa  249  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 720 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  31.18 
 
 		 720 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>