More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5026 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 722 aa  1464    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  90.7 
 
 		 731 aa  1320    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  89.79 
 
 		 725 aa  1275    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  98.61 
 
 		 722 aa  1449    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  89.38 
 
 		 725 aa  1288    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  98.61 
 
 		 722 aa  1449    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  41.19 
 
 		 707 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  42.12 
 
 		 713 aa  527  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  42.12 
 
 		 713 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  43.55 
 
 		 713 aa  525  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  40.96 
 
 		 708 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  41.1 
 
 		 721 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  42.07 
 
 		 714 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  41.92 
 
 		 714 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  43.18 
 
 		 719 aa  511  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  42.54 
 
 		 795 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  42.07 
 
 		 677 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  42.52 
 
 		 795 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  42.07 
 
 		 863 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  41.86 
 
 		 724 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  42.71 
 
 		 778 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  42.39 
 
 		 858 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  42.33 
 
 		 810 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  41.58 
 
 		 781 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  42.39 
 
 		 855 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  42.39 
 
 		 855 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  42.12 
 
 		 921 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  42.12 
 
 		 921 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  42.12 
 
 		 881 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.31 
 
 		 706 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  42.12 
 
 		 679 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  42.12 
 
 		 881 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  41.57 
 
 		 742 aa  485  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  42.12 
 
 		 881 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  42.12 
 
 		 882 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  39.12 
 
 		 766 aa  482  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  40.08 
 
 		 709 aa  482  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  40.44 
 
 		 796 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  39.04 
 
 		 809 aa  479  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  40.2 
 
 		 827 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  39.83 
 
 		 796 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  40.83 
 
 		 796 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  39.62 
 
 		 705 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  39.79 
 
 		 796 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  40.26 
 
 		 726 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  41.16 
 
 		 821 aa  458  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 793 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  39.89 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  35.68 
 
 		 706 aa  361  3e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.84 
 
 		 708 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  30.58 
 
 		 703 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.2 
 
 		 703 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 709 aa  268  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 703 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  33.19 
 
 		 689 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 701 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 722 aa  262  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 696 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.38 
 
 		 696 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 692 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 714 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 		 757 aa  243  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 734 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 712 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 710 aa  240  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 708 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 715 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 722 aa  236  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 732 aa  235  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 694 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 736 aa  231  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 860 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 815 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 711 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.44 
 
 		 709 aa  227  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 715 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 707 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 706 aa  224  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 710 aa  224  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 706 aa  224  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 724 aa  223  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 708 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 723 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 738 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 724 aa  220  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 701 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.73 
 
 		 711 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 710 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 825 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 825 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 701 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 689 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 720 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 743 aa  211  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 723 aa  211  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.69 
 
 		 703 aa  210  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 817 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 741 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 720 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>