More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1180 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  60.9 
 
 
796 aa  856    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  99.71 
 
 
882 aa  1383    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
679 aa  1382    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  57.44 
 
 
810 aa  798    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  99.56 
 
 
881 aa  1382    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  61.01 
 
 
795 aa  833    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  59.76 
 
 
809 aa  863    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  75.55 
 
 
858 aa  1085    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  61.34 
 
 
796 aa  867    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  61.94 
 
 
796 aa  869    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  93.23 
 
 
742 aa  1298    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  56.12 
 
 
766 aa  763    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  99.85 
 
 
881 aa  1387    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  55.67 
 
 
781 aa  744    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  76.44 
 
 
863 aa  1102    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  66.82 
 
 
821 aa  928    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  75.55 
 
 
855 aa  1084    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  99.85 
 
 
921 aa  1388    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  99.85 
 
 
921 aa  1388    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  61.01 
 
 
795 aa  833    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  61.19 
 
 
796 aa  858    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  75.55 
 
 
855 aa  1084    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  99.56 
 
 
881 aa  1382    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  55.44 
 
 
778 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  65.1 
 
 
827 aa  910    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  47.06 
 
 
707 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  46.36 
 
 
721 aa  618  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  47.69 
 
 
719 aa  601  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  45.93 
 
 
714 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  45.93 
 
 
714 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  45.93 
 
 
677 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  46.2 
 
 
708 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  44.2 
 
 
724 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  43.39 
 
 
713 aa  554  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  43.39 
 
 
713 aa  554  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  43.78 
 
 
709 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  43.54 
 
 
713 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  43.59 
 
 
726 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  41.54 
 
 
725 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  42.02 
 
 
722 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  42.02 
 
 
722 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  39.7 
 
 
705 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  41.87 
 
 
731 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  41.9 
 
 
722 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  41.15 
 
 
725 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.06 
 
 
706 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  42.64 
 
 
582 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  38.4 
 
 
793 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 
706 aa  370  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 
712 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 
710 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
701 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 
736 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  32.76 
 
 
689 aa  267  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 
732 aa  266  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 
714 aa  266  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 
708 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
722 aa  265  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  31.95 
 
 
708 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  33.04 
 
 
703 aa  258  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  31.43 
 
 
703 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 
709 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 
692 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 
702 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 
702 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.44 
 
 
711 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 
701 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 
734 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 
757 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 
701 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 
701 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
710 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 
722 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 
701 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.78 
 
 
696 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 
724 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 
741 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 
696 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  29.7 
 
 
723 aa  238  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 
703 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 
815 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 
701 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
724 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 
701 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 
715 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 
738 aa  233  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 
711 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 
708 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 
710 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 
825 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.96 
 
 
709 aa  231  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 
825 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 
743 aa  230  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 
850 aa  229  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 
817 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 
726 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.71 
 
 
703 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 
715 aa  227  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 
726 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 
689 aa  220  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>