More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4917 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  56.44 
 
 		 796 aa  730    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  56.12 
 
 		 796 aa  734    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  55.59 
 
 		 882 aa  751    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  55.44 
 
 		 679 aa  746    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  55.44 
 
 		 921 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 778 aa  1576    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  55.44 
 
 		 881 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  54.61 
 
 		 796 aa  734    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  50.99 
 
 		 809 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  55.44 
 
 		 881 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  55.89 
 
 		 858 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  55.59 
 
 		 742 aa  747    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  53.13 
 
 		 810 aa  691    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  80.97 
 
 		 781 aa  1238    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  55.22 
 
 		 863 aa  748    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  54.96 
 
 		 795 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  55.49 
 
 		 821 aa  720    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  55.74 
 
 		 855 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  55.44 
 
 		 921 aa  749    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  55.41 
 
 		 796 aa  742    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  69.7 
 
 		 766 aa  1055    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  54.67 
 
 		 795 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  54.76 
 
 		 827 aa  733    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  55.44 
 
 		 881 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  55.74 
 
 		 855 aa  735    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  48.74 
 
 		 707 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  47.05 
 
 		 721 aa  595  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  48.52 
 
 		 708 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  47.78 
 
 		 719 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  44.87 
 
 		 677 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  44.87 
 
 		 714 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  44.73 
 
 		 714 aa  565  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  45.93 
 
 		 724 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  45.51 
 
 		 709 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  44.61 
 
 		 713 aa  534  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  44.75 
 
 		 713 aa  535  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  44.1 
 
 		 713 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 		 726 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  42.75 
 
 		 725 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  43.06 
 
 		 731 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  43.57 
 
 		 725 aa  489  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  42.44 
 
 		 722 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  42.44 
 
 		 722 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  42.44 
 
 		 722 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.66 
 
 		 706 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  40.23 
 
 		 705 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  38.12 
 
 		 793 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  38.16 
 
 		 706 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  42.62 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  33.91 
 
 		 710 aa  277  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 712 aa  260  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 692 aa  258  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.79 
 
 		 696 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 696 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.74 
 
 		 708 aa  250  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  31.07 
 
 		 703 aa  250  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 708 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.73 
 
 		 709 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 722 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 709 aa  245  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  33.08 
 
 		 689 aa  245  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.09 
 
 		 703 aa  244  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 701 aa  244  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 710 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 		 708 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.5 
 
 		 711 aa  240  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 711 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 702 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 702 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 703 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 		 701 aa  237  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.12 
 
 		 732 aa  234  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 815 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 701 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 701 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 860 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 701 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 734 aa  228  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 714 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 		 741 aa  226  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 736 aa  226  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 825 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 		 825 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 757 aa  222  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  31.09 
 
 		 703 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 710 aa  219  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 701 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 		 715 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 817 aa  217  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 738 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  30.03 
 
 		 699 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 720 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 701 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 701 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 743 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 726 aa  212  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 726 aa  212  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 722 aa  210  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 743 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 707 aa  207  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>