More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0293 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  72.82 
 
 
689 aa  1026    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
700 aa  1426    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  73.39 
 
 
689 aa  1046    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  73.68 
 
 
698 aa  1052    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  47.31 
 
 
680 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  45.26 
 
 
712 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  44.96 
 
 
749 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  45.33 
 
 
656 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  39.14 
 
 
712 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 
770 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 
710 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 
710 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
707 aa  355  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1439  TonB-dependent receptor protein  31.43 
 
 
688 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 
694 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 
715 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 
706 aa  331  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 
706 aa  331  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 
719 aa  326  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 
757 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 
709 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  34.29 
 
 
695 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 
792 aa  309  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 
860 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 
727 aa  287  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
745 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  31.37 
 
 
708 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  31.55 
 
 
703 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.9 
 
 
703 aa  277  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 
703 aa  276  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 
709 aa  275  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 
726 aa  273  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 
850 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
734 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 
726 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 
701 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 
755 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.24 
 
 
696 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 
732 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 
696 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 
692 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 
732 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 
724 aa  261  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 
722 aa  259  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 
705 aa  257  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 
719 aa  256  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 
736 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 
734 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
743 aa  250  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  29.94 
 
 
753 aa  250  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 
724 aa  249  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 
757 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 
825 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 
753 aa  246  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 
825 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  30.19 
 
 
716 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 
734 aa  243  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 
862 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 
730 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 
817 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 
707 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 
730 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 
730 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 
730 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 
701 aa  238  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 
731 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 
864 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 
751 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 
731 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 
731 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  28.82 
 
 
689 aa  237  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 
726 aa  237  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 
701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 
701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 
742 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 
742 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 
708 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 
724 aa  235  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
693 aa  234  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 
701 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 
701 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 
736 aa  232  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 
771 aa  231  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 
701 aa  230  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 
722 aa  229  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 
701 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  27.95 
 
 
703 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 
710 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 
714 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  28.53 
 
 
732 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 
837 aa  227  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 
689 aa  226  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 
859 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 
740 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 
731 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 
732 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 
710 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 
769 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 
722 aa  220  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 
711 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>