More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1152 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1152  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 790 aa  1605    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1049  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 788 aa  365  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  32.06 
 
 		 796 aa  344  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0878  outer membrane receptor PRHA signal peptide protein  27.45 
 
 		 770 aa  250  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68825  normal  0.0178454 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.98 
 
 		 801 aa  226  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 709 aa  218  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.75 
 
 		 708 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 815 aa  207  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 864 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.65 
 
 		 833 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  28.2 
 
 		 703 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 862 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3440  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 827 aa  196  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.411786  hitchhiker  0.000375138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.36 
 
 		 709 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 825 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 825 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 821 aa  194  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  27.9 
 
 		 799 aa  194  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 850 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 843 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 797 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 710 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 803 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 741 aa  190  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 		 860 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 802 aa  189  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 710 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 799 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 711 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 817 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 708 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4653  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 836 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 859 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 812 aa  182  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 730 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 817 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 829 aa  180  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 708 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.53 
 
 		 711 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 710 aa  179  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 844 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 796 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 726 aa  178  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 743 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 733 aa  177  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 726 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 828 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 778 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 734 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 821 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 722 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  26.5 
 
 		 689 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 701 aa  174  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 689 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 713 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 796 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 796 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 701 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 796 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 819 aa  171  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 826 aa  171  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.85 
 
 		 703 aa  170  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 703 aa  170  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 837 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  23.52 
 
 		 806 aa  168  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 696 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 822 aa  167  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 841 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  23.93 
 
 		 767 aa  167  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 705 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 806 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 692 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 841 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  23.75 
 
 		 789 aa  165  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.01 
 
 		 706 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 797 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.73 
 
 		 696 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 701 aa  163  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 715 aa  163  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 714 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 800 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  26.37 
 
 		 747 aa  162  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 802 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.06 
 
 		 797 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  26.3 
 
 		 745 aa  161  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 732 aa  161  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 863 aa  161  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 831 aa  161  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 730 aa  160  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 822 aa  160  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  26.22 
 
 		 747 aa  160  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 791 aa  160  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 689 aa  160  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 794 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 717 aa  159  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 740 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 794 aa  159  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  26.08 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 738 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 816 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>