More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2284 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 767 aa  1555    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  47.71 
 
 		 769 aa  698    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  40.36 
 
 		 782 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  40.24 
 
 		 809 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  41.05 
 
 		 852 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  41.31 
 
 		 810 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  40.68 
 
 		 786 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  38.71 
 
 		 785 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  39.11 
 
 		 789 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  36.86 
 
 		 907 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  39.25 
 
 		 795 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  36.16 
 
 		 810 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 		 806 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  33.54 
 
 		 808 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 816 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 837 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 812 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 843 aa  237  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 814 aa  231  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 850 aa  230  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 862 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 776 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 859 aa  223  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 864 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 789 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 809 aa  220  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 795 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 807 aa  215  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 817 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 793 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 794 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 791 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.3 
 
 		 708 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.79 
 
 		 703 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 701 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 696 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 		 805 aa  201  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.75 
 
 		 696 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 742 aa  200  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 781 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.9 
 
 		 703 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 825 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  25.58 
 
 		 792 aa  195  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 709 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 825 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 703 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 815 aa  190  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 711 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  23.88 
 
 		 786 aa  180  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 766 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 692 aa  177  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 722 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 860 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 741 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 701 aa  171  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 715 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 726 aa  167  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.16 
 
 		 708 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 719 aa  165  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 707 aa  165  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 734 aa  165  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 726 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 708 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.17 
 
 		 709 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 689 aa  161  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1152  TonB-dependent siderophore receptor  23.93 
 
 		 790 aa  161  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  26.57 
 
 		 691 aa  161  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 730 aa  160  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.24 
 
 		 833 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2327  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 790 aa  158  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929044  normal  0.271692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 743 aa  157  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25.67 
 
 		 801 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 806 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 821 aa  153  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 819 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 694 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 713 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 701 aa  152  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 710 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 770 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 715 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 710 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 710 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 736 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 714 aa  146  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 		 710 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 817 aa  146  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 730 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 778 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 717 aa  145  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 738 aa  145  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 717 aa  144  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 723 aa  144  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 828 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 797 aa  144  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 824 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 724 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25.27 
 
 		 695 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 732 aa  142  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>