More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2785 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 786 aa  1599    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  33.46 
 
 		 792 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 812 aa  331  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 742 aa  306  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 809 aa  270  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.49 
 
 		 708 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 814 aa  234  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.25 
 
 		 703 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 850 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 701 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 785 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 824 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 789 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.31 
 
 		 703 aa  207  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 791 aa  207  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 703 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 806 aa  204  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.78 
 
 		 696 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 696 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 815 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 776 aa  191  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 837 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 709 aa  188  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 781 aa  187  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  23.61 
 
 		 809 aa  185  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 712 aa  185  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 793 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 864 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 907 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 692 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 817 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 816 aa  181  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  23.88 
 
 		 767 aa  180  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 708 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 		 807 aa  177  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 860 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 715 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 718 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 794 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  29.17 
 
 		 689 aa  175  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 720 aa  175  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 829 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 789 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 711 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 795 aa  174  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 743 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 702 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 702 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 701 aa  171  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 713 aa  170  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 689 aa  170  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 859 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 821 aa  168  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.34 
 
 		 713 aa  168  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 843 aa  168  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 724 aa  168  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 		 782 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 701 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.92 
 
 		 709 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 708 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 707 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 713 aa  165  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 805 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 726 aa  165  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 		 810 aa  164  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  26.59 
 
 		 808 aa  164  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 719 aa  164  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 726 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  23.36 
 
 		 852 aa  164  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 720 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 724 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 799 aa  163  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 766 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 786 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 740 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 701 aa  162  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 701 aa  161  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 723 aa  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 828 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 769 aa  160  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 694 aa  160  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 743 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 707 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 734 aa  160  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 701 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 696 aa  159  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 701 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 701 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 770 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  26.79 
 
 		 703 aa  158  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  26.09 
 
 		 696 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 705 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 709 aa  157  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 710 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 715 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  25.53 
 
 		 696 aa  157  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  25.53 
 
 		 698 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 715 aa  156  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 715 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>