More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11443 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  100 
 
 		 792 aa  1612    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 786 aa  416  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 812 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 742 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 809 aa  270  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 809 aa  210  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 815 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 850 aa  200  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.18 
 
 		 708 aa  200  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 814 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 767 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 843 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 785 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 795 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 825 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 806 aa  195  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.28 
 
 		 703 aa  194  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 825 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 711 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 782 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.38 
 
 		 709 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 708 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 701 aa  183  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 791 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 805 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 701 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 824 aa  181  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 862 aa  181  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 810 aa  180  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 705 aa  180  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 810 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 701 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 707 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 709 aa  177  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 703 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  25.13 
 
 		 716 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 722 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 789 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.11 
 
 		 703 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 712 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 864 aa  173  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 786 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 689 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 807 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 708 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 769 aa  171  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  26.24 
 
 		 808 aa  171  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 837 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 696 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 701 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 701 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 860 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 710 aa  168  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 793 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 732 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  26.45 
 
 		 703 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 701 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 701 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 701 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 734 aa  167  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.21 
 
 		 696 aa  167  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 692 aa  167  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 689 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 714 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 736 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 816 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 706 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 706 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 738 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 852 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 817 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 766 aa  164  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 821 aa  163  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 828 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 701 aa  161  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 797 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 722 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 789 aa  160  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  26.89 
 
 		 699 aa  160  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 		 743 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25.04 
 
 		 695 aa  159  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  24 
 
 		 709 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 828 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 714 aa  157  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24 
 
 		 757 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 794 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 828 aa  156  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 723 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 820 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 828 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 707 aa  155  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 771 aa  155  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 907 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 757 aa  153  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 710 aa  153  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 699 aa  153  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 720 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 715 aa  152  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  23.82 
 
 		 808 aa  152  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 776 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>