More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5681 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  47.07 
 
 		 810 aa  669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 786 aa  1615    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  43.49 
 
 		 907 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  41.68 
 
 		 785 aa  613  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  44.69 
 
 		 789 aa  613  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  41.59 
 
 		 810 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  42.03 
 
 		 769 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  40.65 
 
 		 795 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  40.76 
 
 		 809 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  39.04 
 
 		 782 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  38.61 
 
 		 806 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  40.4 
 
 		 767 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  38.95 
 
 		 816 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  39.31 
 
 		 852 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  39.34 
 
 		 808 aa  507  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 812 aa  296  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 824 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 814 aa  238  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 809 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 791 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 789 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 862 aa  211  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 815 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 807 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 859 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 850 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 794 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 793 aa  195  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 864 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 742 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 805 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 825 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 689 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 843 aa  187  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.84 
 
 		 696 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 825 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.26 
 
 		 703 aa  187  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.26 
 
 		 708 aa  187  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 795 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 696 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 837 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.82 
 
 		 713 aa  178  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 817 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.92 
 
 		 713 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 709 aa  176  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 701 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  25.22 
 
 		 792 aa  174  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 781 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.07 
 
 		 703 aa  171  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 703 aa  171  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 713 aa  170  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 741 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 723 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 799 aa  167  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 743 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 726 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  25.76 
 
 		 691 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 786 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 730 aa  163  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 708 aa  162  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 719 aa  162  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 711 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 734 aa  161  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 707 aa  161  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 726 aa  160  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 738 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 708 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.16 
 
 		 692 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 766 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 767 aa  159  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 724 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 723 aa  157  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  27.2 
 
 		 689 aa  154  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 		 860 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 724 aa  154  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.65 
 
 		 709 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  26.11 
 
 		 799 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 710 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 770 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 743 aa  152  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 796 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 722 aa  150  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 720 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 710 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 781 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2327  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 790 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929044  normal  0.271692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.65 
 
 		 724 aa  148  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25.15 
 
 		 801 aa  146  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 707 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 710 aa  145  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 778 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 806 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 707 aa  144  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  24.45 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 794 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 714 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 706 aa  141  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 715 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 730 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>