More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0102 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 795 aa  1633    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  65.83 
 
 		 776 aa  1050    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 860 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 824 aa  241  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 815 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 812 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 789 aa  233  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 837 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 785 aa  231  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 814 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 810 aa  220  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 767 aa  218  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 825 aa  217  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 825 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 710 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 817 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 710 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 770 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 762 aa  208  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 757 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 709 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 769 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 792 aa  204  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 864 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 809 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 816 aa  200  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 782 aa  200  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 715 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 850 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 707 aa  197  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 806 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 726 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 694 aa  196  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 743 aa  196  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 726 aa  195  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 701 aa  193  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 727 aa  192  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 696 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 701 aa  191  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 807 aa  191  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 791 aa  191  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.76 
 
 		 696 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 794 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 852 aa  188  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  29.12 
 
 		 680 aa  187  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 711 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 795 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 789 aa  187  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 702 aa  187  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 702 aa  187  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 700 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 757 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 708 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 793 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 708 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 696 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.1 
 
 		 703 aa  185  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 698 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 719 aa  184  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 733 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 786 aa  184  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 689 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 706 aa  183  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 706 aa  183  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 862 aa  181  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 689 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 713 aa  181  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 810 aa  180  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.54 
 
 		 708 aa  180  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 710 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.77 
 
 		 709 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 859 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 705 aa  178  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.96 
 
 		 833 aa  178  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 817 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  26.64 
 
 		 799 aa  177  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 843 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 731 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 781 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 707 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 734 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 721 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  26.9 
 
 		 689 aa  174  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 703 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 771 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 786 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 714 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  25.92 
 
 		 696 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 778 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 747 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 713 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 829 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 726 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 799 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 828 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.99 
 
 		 718 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 907 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.45 
 
 		 703 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 771 aa  172  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  26.19 
 
 		 698 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>