More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2327 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2327  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 790 aa  1622    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929044  normal  0.271692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 711 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 708 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 708 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.87 
 
 		 709 aa  214  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 864 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 837 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 817 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.6 
 
 		 711 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 710 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 859 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 741 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 862 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 743 aa  187  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 850 aa  187  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 825 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 713 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 825 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 815 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 860 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 726 aa  183  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 722 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 706 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 706 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.02 
 
 		 728 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 703 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 843 aa  174  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.31 
 
 		 724 aa  174  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 733 aa  173  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 724 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.58 
 
 		 703 aa  170  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 809 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.69 
 
 		 695 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 778 aa  167  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 710 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 821 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 730 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 719 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 757 aa  165  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 715 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 819 aa  164  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 703 aa  163  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 817 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 730 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 841 aa  161  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 737 aa  160  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 713 aa  160  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 701 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.72 
 
 		 708 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 709 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 753 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 806 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.86 
 
 		 703 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 707 aa  158  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 757 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 767 aa  158  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  26.61 
 
 		 740 aa  158  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 863 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 824 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.11 
 
 		 696 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 745 aa  157  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 696 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 822 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.77 
 
 		 718 aa  155  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25.36 
 
 		 801 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 877 aa  154  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 750 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 795 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 728 aa  153  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 826 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 745 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 796 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 726 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  25.21 
 
 		 713 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 767 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 802 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 665 aa  152  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 797 aa  152  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 		 799 aa  151  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 		 803 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 728 aa  151  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 701 aa  150  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 757 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 711 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  24.93 
 
 		 713 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 789 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 714 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 786 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 817 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 795 aa  149  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 769 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  24.64 
 
 		 715 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 791 aa  149  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 709 aa  149  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 694 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 769 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 787 aa  147  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 733 aa  146  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>