More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2846 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  100 
 
 		 728 aa  1480    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2554  TonB-dependent siderophore receptor  32.72 
 
 		 776 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3559  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 		 707 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.740421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  30.16 
 
 		 696 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 713 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 850 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 696 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 862 aa  248  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 860 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 710 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 837 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 692 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 711 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 843 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 708 aa  230  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 708 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 817 aa  227  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  29.09 
 
 		 703 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 719 aa  225  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 709 aa  224  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 703 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 701 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.55 
 
 		 709 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.73 
 
 		 711 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  28.65 
 
 		 708 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.92 
 
 		 703 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  30.32 
 
 		 695 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 743 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  31.61 
 
 		 741 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 733 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 710 aa  207  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 864 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 825 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 701 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 778 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 825 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 706 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 821 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 706 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 726 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 829 aa  201  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 859 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  29.49 
 
 		 716 aa  197  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 715 aa  197  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.19 
 
 		 724 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 726 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 701 aa  195  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 723 aa  195  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 712 aa  194  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  27.08 
 
 		 691 aa  194  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 815 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 727 aa  194  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 726 aa  193  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 723 aa  193  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  29.7 
 
 		 722 aa  193  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 736 aa  193  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2327  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 790 aa  190  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929044  normal  0.271692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 796 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 719 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 767 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 701 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 757 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 734 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 701 aa  187  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 730 aa  185  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 796 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 745 aa  183  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 819 aa  182  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 722 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.83 
 
 		 713 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 730 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  27.75 
 
 		 808 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.32 
 
 		 801 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00024  TonB-dependent receptor  58.49 
 
 		 163 aa  180  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0168751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 796 aa  180  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.89 
 
 		 713 aa  180  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.25 
 
 		 703 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 700 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 796 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  26.68 
 
 		 716 aa  179  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 817 aa  178  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 799 aa  178  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 829 aa  178  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  27.02 
 
 		 719 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 707 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 831 aa  177  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 770 aa  177  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 750 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 771 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 710 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 738 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 797 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 706 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 714 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 689 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 725 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 689 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 732 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 710 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>