More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2554 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2554  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 776 aa  1584    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3559  TonB-dependent siderophore receptor  41.69 
 
 		 707 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.740421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.72 
 
 		 728 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 		 843 aa  223  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 850 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.83 
 
 		 833 aa  217  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 715 aa  214  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 708 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 862 aa  212  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 860 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 741 aa  210  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 706 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 706 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  28.74 
 
 		 740 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 703 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.93 
 
 		 797 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 864 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 778 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 730 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 726 aa  196  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 701 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 726 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.78 
 
 		 703 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 817 aa  195  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 722 aa  194  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.69 
 
 		 806 aa  194  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 794 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  28.34 
 
 		 747 aa  193  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 743 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.36 
 
 		 696 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 771 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 771 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 820 aa  190  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 710 aa  190  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 708 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 696 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 771 aa  187  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  28.12 
 
 		 747 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  27.98 
 
 		 747 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 825 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 799 aa  186  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 726 aa  185  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 745 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 825 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 802 aa  184  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 692 aa  183  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 707 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 859 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 817 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 829 aa  181  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 730 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 713 aa  181  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 710 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 797 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 727 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  28.49 
 
 		 716 aa  179  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  27.03 
 
 		 808 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 689 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 821 aa  178  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  27.65 
 
 		 729 aa  177  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 736 aa  177  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.26 
 
 		 801 aa  177  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.97 
 
 		 703 aa  177  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 711 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  28.29 
 
 		 695 aa  177  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 750 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 837 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 724 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 733 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.8 
 
 		 709 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.92 
 
 		 711 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  26.34 
 
 		 719 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 810 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 797 aa  174  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.66 
 
 		 708 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 829 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 710 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 724 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 806 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 863 aa  171  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 770 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 710 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 815 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 808 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 709 aa  169  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 705 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  27.34 
 
 		 747 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 828 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 719 aa  168  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  27.17 
 
 		 752 aa  167  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 776 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  27.21 
 
 		 747 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 742 aa  167  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 728 aa  167  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 740 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  27.21 
 
 		 747 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 815 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 819 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>