More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2005 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  96.41 
 
 		 724 aa  1390    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  68.07 
 
 		 719 aa  974    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  63.61 
 
 		 755 aa  905    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  95.16 
 
 		 705 aa  1341    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 724 aa  1460    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  63.94 
 
 		 756 aa  907    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  56.12 
 
 		 771 aa  746    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  46.21 
 
 		 727 aa  581  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  44.53 
 
 		 755 aa  538  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 		 707 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  41.55 
 
 		 735 aa  469  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 693 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 709 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 757 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  34.42 
 
 		 710 aa  340  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  34.37 
 
 		 770 aa  339  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 		 707 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 710 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 719 aa  333  8e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 792 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  35.05 
 
 		 706 aa  326  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  35.05 
 
 		 706 aa  326  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  34.86 
 
 		 695 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 715 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 694 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 689 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 700 aa  273  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 689 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 821 aa  265  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  29.33 
 
 		 753 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 766 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 698 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 745 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 743 aa  258  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 747 aa  257  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 726 aa  257  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 726 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 732 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  31.2 
 
 		 772 aa  251  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 747 aa  250  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 748 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 748 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  31.58 
 
 		 748 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 747 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 740 aa  247  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 747 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  29.98 
 
 		 680 aa  245  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 732 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 748 aa  242  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 749 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 747 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 747 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 656 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 712 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 759 aa  241  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 759 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 747 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 708 aa  236  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 850 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 742 aa  235  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 742 aa  235  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 777 aa  234  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 732 aa  234  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 		 769 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 734 aa  233  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 749 aa  232  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  30.63 
 
 		 765 aa  231  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 860 aa  230  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 753 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 724 aa  229  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 753 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 837 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 689 aa  228  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 733 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 726 aa  228  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 731 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 741 aa  224  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 751 aa  223  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 741 aa  221  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 730 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 817 aa  220  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 826 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 733 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 736 aa  219  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.01 
 
 		 711 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 712 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 734 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 733 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 730 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 736 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 738 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 730 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 730 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 710 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 732 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 714 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 769 aa  214  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 734 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 730 aa  213  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 722 aa  213  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>