More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0720 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  88.9 
 
 		 730 aa  1356    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  49.29 
 
 		 747 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  99.32 
 
 		 730 aa  1496    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  44.99 
 
 		 766 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  99.45 
 
 		 730 aa  1496    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  46.29 
 
 		 749 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  99.59 
 
 		 730 aa  1499    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  89.88 
 
 		 731 aa  1386    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  89.33 
 
 		 731 aa  1377    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  89.88 
 
 		 731 aa  1384    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 730 aa  1504    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  46.08 
 
 		 753 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  44.22 
 
 		 759 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  44.22 
 
 		 759 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  43.82 
 
 		 747 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  43.49 
 
 		 780 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  44.87 
 
 		 748 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  45.29 
 
 		 772 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  44.87 
 
 		 748 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  44.87 
 
 		 748 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  43.29 
 
 		 747 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  43.43 
 
 		 747 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  43.03 
 
 		 747 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  43.43 
 
 		 747 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  43.29 
 
 		 747 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  43.81 
 
 		 753 aa  602  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  43.87 
 
 		 773 aa  601  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  45.2 
 
 		 748 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  44.74 
 
 		 763 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  43.63 
 
 		 768 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  43.97 
 
 		 760 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  43.11 
 
 		 762 aa  584  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  40.08 
 
 		 776 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  41.23 
 
 		 769 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  35.85 
 
 		 826 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  41.92 
 
 		 724 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  39.53 
 
 		 741 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  40.7 
 
 		 740 aa  515  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  40.69 
 
 		 741 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  36.72 
 
 		 794 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 751 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 793 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  34.73 
 
 		 794 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 		 793 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  35.29 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 		 731 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 805 aa  360  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 859 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 732 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 733 aa  344  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  32.3 
 
 		 743 aa  342  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  33.29 
 
 		 843 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 733 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  31.93 
 
 		 760 aa  331  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  31.84 
 
 		 760 aa  330  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 760 aa  330  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  31.93 
 
 		 760 aa  330  6e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  31.93 
 
 		 760 aa  330  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  31.84 
 
 		 760 aa  330  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 732 aa  330  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  31.84 
 
 		 760 aa  330  6e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 		 732 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  31.97 
 
 		 764 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  31.71 
 
 		 760 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 		 769 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 777 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  29.81 
 
 		 763 aa  313  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 733 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 769 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 751 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 753 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 733 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 733 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  29.58 
 
 		 779 aa  306  7e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 821 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 742 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 742 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 745 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 734 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 790 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  29.66 
 
 		 754 aa  298  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  29.49 
 
 		 761 aa  290  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 785 aa  287  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 779 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 847 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 767 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 768 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 736 aa  277  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 734 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0611  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 773 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000075991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 823 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 748 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 727 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 707 aa  241  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 700 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 719 aa  238  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 720 aa  233  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 698 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 694 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 689 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>