More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1524 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 847 aa  1745    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  34.82 
 
 		 763 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  33.8 
 
 		 779 aa  432  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  33.64 
 
 		 754 aa  415  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  34.06 
 
 		 765 aa  415  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  32.23 
 
 		 760 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 		 760 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  32.23 
 
 		 760 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  32.35 
 
 		 760 aa  389  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  32.35 
 
 		 760 aa  389  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  32.23 
 
 		 760 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  32.23 
 
 		 760 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  32.1 
 
 		 760 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 766 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 747 aa  336  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 749 aa  336  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 747 aa  334  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 747 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 747 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 747 aa  330  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 747 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 747 aa  326  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 748 aa  324  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  31.36 
 
 		 772 aa  317  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 769 aa  316  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 759 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 748 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 748 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  31.23 
 
 		 748 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 769 aa  313  9e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 759 aa  313  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  29.27 
 
 		 753 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 769 aa  306  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 764 aa  296  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 780 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 763 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 760 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 773 aa  291  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  29.66 
 
 		 730 aa  288  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 768 aa  287  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 730 aa  287  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 731 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 730 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 730 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 731 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 785 aa  282  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 731 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 731 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 762 aa  281  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 794 aa  280  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 724 aa  277  8e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 733 aa  274  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  28.65 
 
 		 743 aa  273  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 733 aa  271  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 753 aa  271  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 732 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 741 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 741 aa  267  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 740 aa  266  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 826 aa  264  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 776 aa  264  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 751 aa  261  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 742 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 742 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 790 aa  252  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 823 aa  251  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  28.52 
 
 		 753 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 733 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 733 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 751 aa  241  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 733 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 732 aa  233  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 792 aa  233  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 732 aa  232  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 821 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 803 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 734 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 734 aa  209  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 736 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 745 aa  207  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 793 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  24.46 
 
 		 794 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 727 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 777 aa  201  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 		 719 aa  201  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 793 aa  201  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 755 aa  197  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 768 aa  194  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 767 aa  194  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 748 aa  194  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 707 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 710 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 859 aa  191  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 694 aa  190  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 770 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 710 aa  187  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 		 720 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 737 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0611  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 773 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000075991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>