More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1708 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  46.79 
 
 		 760 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  47.06 
 
 		 760 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  95.94 
 
 		 763 aa  1493    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  100 
 
 		 779 aa  1607    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  46.93 
 
 		 760 aa  665    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  46.79 
 
 		 760 aa  665    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  46.79 
 
 		 760 aa  662    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  48.96 
 
 		 754 aa  728    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  46.93 
 
 		 760 aa  666    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  47.06 
 
 		 760 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  47.06 
 
 		 760 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  45.24 
 
 		 765 aa  591  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  33.25 
 
 		 847 aa  430  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 		 764 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 747 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 747 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 		 747 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  34.94 
 
 		 772 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 		 769 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  35.4 
 
 		 748 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  35.69 
 
 		 748 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  35.52 
 
 		 747 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  35.4 
 
 		 748 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 748 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 747 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 747 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 769 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 747 aa  379  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 766 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 		 749 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  33.73 
 
 		 753 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 768 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  33.17 
 
 		 760 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 		 780 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  33.12 
 
 		 773 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  33.81 
 
 		 763 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 759 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 		 759 aa  346  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 785 aa  343  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 769 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 		 762 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 		 741 aa  327  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 741 aa  326  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 823 aa  324  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 724 aa  323  7e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 		 731 aa  319  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 753 aa  314  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  30.44 
 
 		 826 aa  313  7.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  30.53 
 
 		 743 aa  311  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 730 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 740 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 730 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 731 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 730 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 731 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 730 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 733 aa  306  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 731 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 794 aa  305  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  28.64 
 
 		 730 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 733 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 776 aa  289  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 733 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 790 aa  283  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 732 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 733 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 733 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 821 aa  276  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 734 aa  256  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 815 aa  254  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 732 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 745 aa  251  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 732 aa  251  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 793 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 742 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 742 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  27.72 
 
 		 794 aa  244  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 751 aa  243  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 751 aa  242  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 777 aa  240  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 793 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 734 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 753 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 779 aa  239  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 805 aa  237  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 736 aa  237  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 768 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 767 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 727 aa  232  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 720 aa  221  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 859 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 719 aa  213  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0611  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 773 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000075991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  25.33 
 
 		 843 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 737 aa  211  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  27.28 
 
 		 722 aa  211  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 706 aa  210  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 706 aa  210  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 700 aa  205  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 803 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>