More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1948 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 815 aa  1688    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  38.45 
 
 		 748 aa  485  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 		 759 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 777 aa  317  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 821 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 745 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 734 aa  302  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 780 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 768 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 763 aa  290  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 773 aa  290  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 732 aa  289  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 742 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 742 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 751 aa  286  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 732 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 759 aa  284  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 760 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 759 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  29.15 
 
 		 753 aa  281  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 733 aa  281  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 734 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 747 aa  278  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 736 aa  278  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 753 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  28.87 
 
 		 765 aa  273  9e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 749 aa  268  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 747 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 776 aa  266  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 747 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 766 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 769 aa  262  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 747 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 733 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 747 aa  260  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 747 aa  260  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 741 aa  258  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 753 aa  258  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 740 aa  257  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 747 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 732 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  29.07 
 
 		 779 aa  253  7e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 748 aa  252  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 731 aa  252  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  28.57 
 
 		 763 aa  251  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  28.24 
 
 		 748 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 748 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 764 aa  248  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 748 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 769 aa  247  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  28.08 
 
 		 772 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  29.55 
 
 		 754 aa  243  9e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 733 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 785 aa  238  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  29.7 
 
 		 733 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  27.48 
 
 		 743 aa  236  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 741 aa  232  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 724 aa  233  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 		 733 aa  227  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 707 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 710 aa  224  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 727 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 769 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 762 aa  222  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 719 aa  220  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 770 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 710 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 794 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 737 aa  217  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 771 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  27.91 
 
 		 760 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  26.72 
 
 		 794 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 826 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 760 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  28.45 
 
 		 760 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  28.45 
 
 		 760 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  27.77 
 
 		 760 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  27.77 
 
 		 760 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  27.77 
 
 		 760 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 760 aa  214  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  27.77 
 
 		 760 aa  213  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 715 aa  212  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 694 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 792 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 823 aa  209  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 805 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 790 aa  207  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 706 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 706 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 722 aa  204  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 709 aa  203  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 757 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 767 aa  201  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 720 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 843 aa  201  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 793 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 739 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 803 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 793 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 817 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>