More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0894 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  47.14 
 
 
776 aa  640    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  53.41 
 
 
780 aa  747    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  52.79 
 
 
768 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  57.49 
 
 
759 aa  819    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  44.2 
 
 
826 aa  664    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  53.73 
 
 
766 aa  758    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  88.77 
 
 
748 aa  1316    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  49.72 
 
 
762 aa  656    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  48.61 
 
 
747 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  91.58 
 
 
748 aa  1333    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  88.77 
 
 
748 aa  1318    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  50.96 
 
 
773 aa  724    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  90.91 
 
 
747 aa  1382    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
747 aa  1541    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  87.7 
 
 
772 aa  1301    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  78.27 
 
 
749 aa  1187    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  51.26 
 
 
760 aa  721    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  91.84 
 
 
747 aa  1372    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  53.72 
 
 
763 aa  743    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  88.77 
 
 
748 aa  1318    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  91.98 
 
 
747 aa  1374    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  91.18 
 
 
747 aa  1387    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  56.92 
 
 
759 aa  807    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  48.47 
 
 
753 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  91.98 
 
 
747 aa  1374    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  43.82 
 
 
730 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  43.96 
 
 
730 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  43.82 
 
 
730 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  43.56 
 
 
730 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  44.16 
 
 
731 aa  625  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  44.02 
 
 
731 aa  625  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  44.02 
 
 
731 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  44.68 
 
 
730 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  46.2 
 
 
741 aa  598  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  42.14 
 
 
753 aa  595  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  41.91 
 
 
769 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  42.88 
 
 
794 aa  550  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  41.49 
 
 
724 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  41.4 
 
 
741 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 
740 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 
731 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  37.97 
 
 
760 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  37.97 
 
 
760 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  37.6 
 
 
733 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  37.98 
 
 
760 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  38.21 
 
 
733 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  38.52 
 
 
760 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  38.4 
 
 
732 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  38.24 
 
 
760 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  38.24 
 
 
760 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  38.66 
 
 
760 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  38.24 
 
 
760 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  39.28 
 
 
765 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  37.26 
 
 
751 aa  442  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  37.94 
 
 
733 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  36.47 
 
 
794 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  37.85 
 
 
733 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 
793 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  37.45 
 
 
733 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  36.14 
 
 
793 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  35.16 
 
 
763 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  36.02 
 
 
754 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  34.72 
 
 
779 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 
769 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  34.42 
 
 
743 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  35.42 
 
 
764 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  34.32 
 
 
805 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 
859 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  34.82 
 
 
821 aa  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 
769 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 
823 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  33.51 
 
 
843 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 
745 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 
753 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 
785 aa  346  8e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 
847 aa  346  8.999999999999999e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 
734 aa  342  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
742 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
742 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 
732 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 
751 aa  335  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  31.61 
 
 
732 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 
727 aa  323  8e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
790 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 
736 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 
768 aa  316  9e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 
767 aa  316  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 
779 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 
734 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  29.97 
 
 
761 aa  300  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 
803 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0611  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 
773 aa  286  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000075991  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 
777 aa  285  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 
755 aa  275  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 
719 aa  270  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 
710 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 
720 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 
719 aa  260  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 
815 aa  260  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 
724 aa  258  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>