More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0829 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  99.47 
 
 		 760 aa  1556    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  99.21 
 
 		 760 aa  1552    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  99.34 
 
 		 760 aa  1555    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  99.08 
 
 		 760 aa  1551    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  49.58 
 
 		 754 aa  681    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  47.09 
 
 		 763 aa  674    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  99.47 
 
 		 760 aa  1556    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  46.93 
 
 		 779 aa  678    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  99.21 
 
 		 760 aa  1552    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  100 
 
 		 760 aa  1563    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  99.21 
 
 		 760 aa  1552    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  44.52 
 
 		 765 aa  560  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  38.25 
 
 		 747 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  37.11 
 
 		 747 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  37.24 
 
 		 747 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  37.6 
 
 		 748 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 747 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  37.74 
 
 		 748 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  37.35 
 
 		 773 aa  429  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  37.57 
 
 		 747 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  37.74 
 
 		 748 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 747 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  37.11 
 
 		 772 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  37.64 
 
 		 748 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 		 747 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  37.35 
 
 		 768 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 749 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  36.85 
 
 		 780 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  37.3 
 
 		 760 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 766 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  36.72 
 
 		 763 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  35.54 
 
 		 753 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 		 847 aa  398  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 759 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  34.69 
 
 		 759 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 		 764 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 		 731 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 		 769 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 741 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 769 aa  363  6e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 733 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 		 769 aa  357  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 		 753 aa  355  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  32.57 
 
 		 743 aa  353  7e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 776 aa  350  8e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 		 730 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 730 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 741 aa  348  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 		 731 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 730 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 		 731 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 731 aa  343  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 826 aa  343  8e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 733 aa  342  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 730 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 762 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 		 740 aa  340  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 732 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 		 794 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  31.47 
 
 		 730 aa  330  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 733 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 785 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 733 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 821 aa  306  7e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 724 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 733 aa  297  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 734 aa  292  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 823 aa  284  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 732 aa  281  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 790 aa  278  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  29.92 
 
 		 794 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 745 aa  273  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 732 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 734 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 736 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 753 aa  256  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 793 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 777 aa  254  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 751 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 727 aa  253  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 751 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 742 aa  250  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 742 aa  250  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 748 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 793 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 803 aa  247  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 768 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 767 aa  243  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 859 aa  240  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  27.17 
 
 		 761 aa  231  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 720 aa  230  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 815 aa  230  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 779 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 770 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 805 aa  227  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 710 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  27.64 
 
 		 843 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 710 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 737 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 771 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>