More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1637 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  45.91 
 
 
760 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  46.17 
 
 
760 aa  665    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  45.91 
 
 
760 aa  662    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  49.15 
 
 
754 aa  728    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  45.91 
 
 
760 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  46.17 
 
 
760 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  46.17 
 
 
760 aa  665    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  46.04 
 
 
760 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  46.04 
 
 
760 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  100 
 
 
763 aa  1566    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  95.94 
 
 
779 aa  1504    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  44.43 
 
 
765 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  34.82 
 
 
847 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  35.73 
 
 
764 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 
747 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  34.84 
 
 
772 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 
747 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  34.93 
 
 
748 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 
769 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 
748 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 
748 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  34.96 
 
 
747 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  35.51 
 
 
748 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  35.13 
 
 
747 aa  386  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
769 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  35 
 
 
747 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  35.13 
 
 
747 aa  386  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  33.64 
 
 
747 aa  379  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 
749 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  33.6 
 
 
753 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 
766 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  34.7 
 
 
768 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 
780 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 
760 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  33.69 
 
 
773 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 
763 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 
759 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 
759 aa  351  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 
785 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 
769 aa  335  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 
724 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  32.52 
 
 
762 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  33.88 
 
 
741 aa  327  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 
741 aa  327  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 
753 aa  320  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 
731 aa  318  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 
823 aa  317  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 
826 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 
730 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 
731 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 
731 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 
731 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  30.49 
 
 
743 aa  314  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 
730 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 
730 aa  313  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 
740 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 
730 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 
733 aa  310  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  31.26 
 
 
794 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  29.62 
 
 
730 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 
776 aa  296  7e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  30.56 
 
 
733 aa  291  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 
733 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 
790 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 
733 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 
733 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  29.11 
 
 
732 aa  280  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 
821 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 
732 aa  261  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 
734 aa  260  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 
732 aa  260  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 
793 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 
745 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 
751 aa  255  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  28.06 
 
 
794 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 
815 aa  251  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
793 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 
742 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 
742 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
779 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 
734 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
777 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 
736 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 
751 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 
768 aa  238  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 
767 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 
753 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  28.33 
 
 
805 aa  234  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 
727 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 
720 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 
737 aa  223  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
859 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 
719 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 
803 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 
706 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 
706 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0611  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 
773 aa  211  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000075991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  25.23 
 
 
843 aa  208  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 
700 aa  207  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 
722 aa  206  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>