More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4373 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 751 aa  1522    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 731 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 731 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  37.37 
 
 		 731 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  37.06 
 
 		 753 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  37.89 
 
 		 730 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 		 766 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 730 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 730 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 730 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 		 730 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  36.98 
 
 		 747 aa  445  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  37.24 
 
 		 759 aa  439  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  34.77 
 
 		 753 aa  438  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  37.52 
 
 		 759 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  37.36 
 
 		 748 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  37.66 
 
 		 724 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  36.58 
 
 		 749 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  38.07 
 
 		 748 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  36.24 
 
 		 780 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  37.53 
 
 		 748 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  37.53 
 
 		 748 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  36.23 
 
 		 747 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  37.26 
 
 		 747 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 747 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  36.34 
 
 		 760 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  35.35 
 
 		 747 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 763 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  35.35 
 
 		 747 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  36.28 
 
 		 772 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 		 747 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  36.48 
 
 		 768 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 		 773 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 769 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 740 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  34.51 
 
 		 741 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 762 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  34.38 
 
 		 741 aa  362  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 		 794 aa  360  6e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 776 aa  352  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 826 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  32.31 
 
 		 743 aa  335  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 733 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 732 aa  333  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 731 aa  331  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 733 aa  297  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 733 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 733 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 733 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  29.52 
 
 		 794 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 793 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 793 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  31.8 
 
 		 765 aa  271  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 769 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 821 aa  271  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 764 aa  267  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 769 aa  261  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 847 aa  259  9e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 777 aa  259  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 823 aa  253  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 734 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 785 aa  252  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 732 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  30.53 
 
 		 754 aa  251  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  27.71 
 
 		 763 aa  251  3e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  28.23 
 
 		 761 aa  249  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 745 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  27.51 
 
 		 760 aa  248  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  27.51 
 
 		 760 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  27.51 
 
 		 760 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 760 aa  247  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 732 aa  247  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  27.38 
 
 		 760 aa  247  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  27.38 
 
 		 760 aa  247  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 719 aa  246  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 736 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  27.38 
 
 		 760 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 734 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  27.38 
 
 		 760 aa  243  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  27.56 
 
 		 779 aa  243  7e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 760 aa  243  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 790 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 779 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 727 aa  240  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 792 aa  237  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 805 aa  234  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 737 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 768 aa  231  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 767 aa  231  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 710 aa  231  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 753 aa  230  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 742 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 742 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 770 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 859 aa  229  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0611  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 773 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000075991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 710 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 803 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 755 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 751 aa  220  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>