More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5005 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 736 aa  1506    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  52.81 
 
 		 742 aa  746    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  54.56 
 
 		 751 aa  748    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  64.06 
 
 		 745 aa  947    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  73.98 
 
 		 732 aa  1112    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  73.98 
 
 		 732 aa  1112    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  53.95 
 
 		 753 aa  732    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  94.02 
 
 		 734 aa  1396    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  97.83 
 
 		 734 aa  1384    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  52.81 
 
 		 742 aa  746    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 770 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 710 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 710 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 769 aa  352  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  33.38 
 
 		 753 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 		 733 aa  340  8e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 747 aa  336  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 760 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 753 aa  330  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 768 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  32.07 
 
 		 719 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  35.35 
 
 		 733 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 		 733 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  33.16 
 
 		 733 aa  327  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 792 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  33.51 
 
 		 749 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 821 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 777 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 732 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 747 aa  321  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  35.02 
 
 		 780 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 747 aa  318  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 759 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 763 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 759 aa  317  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 731 aa  317  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 		 773 aa  316  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 		 720 aa  316  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 740 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 747 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 747 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  33 
 
 		 733 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 		 706 aa  312  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 		 706 aa  312  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 747 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  32.07 
 
 		 741 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 748 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 707 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 766 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 722 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  32.63 
 
 		 765 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  31.41 
 
 		 772 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 727 aa  302  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 		 748 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  31.46 
 
 		 748 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 737 aa  299  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 748 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 715 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  31.38 
 
 		 743 aa  299  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 794 aa  298  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 730 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  30.09 
 
 		 695 aa  297  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 730 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 694 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 		 731 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 730 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 739 aa  295  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 730 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 724 aa  294  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 731 aa  293  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 757 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 815 aa  293  8e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 731 aa  293  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 709 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 767 aa  286  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  30.81 
 
 		 730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  33.01 
 
 		 790 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 762 aa  283  9e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 759 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  30.65 
 
 		 760 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  30.75 
 
 		 760 aa  275  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 760 aa  275  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  30.65 
 
 		 760 aa  275  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  30.65 
 
 		 760 aa  275  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1569  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 767 aa  275  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.428413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  30.75 
 
 		 760 aa  275  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 755 aa  274  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 776 aa  273  9e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  31.26 
 
 		 794 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  30.45 
 
 		 760 aa  272  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  30.38 
 
 		 760 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 760 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 793 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 769 aa  270  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 748 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 700 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 826 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  31.16 
 
 		 843 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 735 aa  261  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>