More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1569 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  58.01 
 
 		 767 aa  858    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  59.97 
 
 		 737 aa  874    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  56.07 
 
 		 760 aa  850    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1569  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 767 aa  1568    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.428413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  46.14 
 
 		 739 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 720 aa  327  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 722 aa  306  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 745 aa  301  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 742 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 742 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 		 719 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 753 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 732 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 751 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 732 aa  283  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 		 734 aa  278  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 734 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 736 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 715 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 707 aa  257  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 694 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 770 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 710 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 710 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 792 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 741 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 757 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 706 aa  231  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 706 aa  231  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 709 aa  230  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 821 aa  230  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 733 aa  228  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  26.22 
 
 		 743 aa  223  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 727 aa  223  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 740 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  28.51 
 
 		 695 aa  221  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 724 aa  219  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 769 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 760 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 773 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  28.12 
 
 		 753 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 768 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 759 aa  209  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 780 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 747 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 759 aa  203  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 803 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 733 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 777 aa  200  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 763 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 731 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 753 aa  200  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 748 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  27.17 
 
 		 748 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 748 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 748 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 748 aa  195  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  26.92 
 
 		 772 aa  194  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 815 aa  194  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 776 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 751 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 731 aa  191  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 747 aa  191  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 730 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 732 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 731 aa  190  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 733 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 730 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 730 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 731 aa  189  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 747 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  26.51 
 
 		 765 aa  189  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 766 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 730 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 747 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 747 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 747 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 747 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 749 aa  187  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  24.9 
 
 		 754 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 826 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 689 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 790 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 764 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 733 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  24.12 
 
 		 763 aa  181  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 733 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 689 aa  181  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  25.07 
 
 		 730 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 762 aa  177  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 759 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 769 aa  176  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 698 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  23.93 
 
 		 779 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  26.3 
 
 		 843 aa  170  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  24.28 
 
 		 760 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  24.28 
 
 		 760 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 769 aa  168  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  24.83 
 
 		 760 aa  167  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>