More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1078 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 748 aa  1506    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  42.63 
 
 		 759 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  38.17 
 
 		 815 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  31.77 
 
 		 753 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 760 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 768 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 		 732 aa  295  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  31.83 
 
 		 732 aa  295  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 745 aa  293  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 759 aa  290  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 780 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 759 aa  286  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 777 aa  286  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 766 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 763 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 734 aa  280  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 731 aa  278  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 753 aa  277  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 821 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 753 aa  271  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 785 aa  269  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 		 733 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 747 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 747 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 773 aa  260  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  30 
 
 		 754 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 747 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 730 aa  257  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 764 aa  256  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 730 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 747 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 730 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 736 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 747 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 734 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 748 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 731 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 751 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 742 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 730 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 742 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  30.18 
 
 		 765 aa  254  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 731 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 747 aa  252  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 741 aa  252  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 731 aa  251  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  28.8 
 
 		 730 aa  250  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  28.71 
 
 		 772 aa  250  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 747 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 749 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 733 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 748 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  27.09 
 
 		 748 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 748 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 719 aa  243  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 769 aa  241  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 790 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 769 aa  238  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  29.92 
 
 		 760 aa  237  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  29.63 
 
 		 760 aa  237  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 769 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  29.63 
 
 		 760 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  29.63 
 
 		 760 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 760 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  29.75 
 
 		 760 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 793 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  29.75 
 
 		 760 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  29.49 
 
 		 760 aa  234  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 710 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 770 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 710 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 732 aa  231  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 741 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 762 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  28.19 
 
 		 794 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  27.87 
 
 		 743 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 805 aa  225  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 793 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 707 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 826 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 823 aa  217  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 794 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 733 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 776 aa  214  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 733 aa  213  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 733 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  28.22 
 
 		 843 aa  211  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 767 aa  210  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 740 aa  209  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 720 aa  207  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 722 aa  205  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 724 aa  204  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 751 aa  203  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 859 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 737 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 771 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 792 aa  195  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 847 aa  193  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  26.25 
 
 		 779 aa  193  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1569  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 767 aa  193  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.428413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>