More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1513 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  58.74 
 
 		 793 aa  918    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  64.84 
 
 		 843 aa  1085    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  59.28 
 
 		 793 aa  915    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  59.91 
 
 		 794 aa  931    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 859 aa  1749    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  58.58 
 
 		 805 aa  949    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  36.13 
 
 		 753 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  34.8 
 
 		 759 aa  376  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  34.8 
 
 		 759 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 753 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  35.53 
 
 		 772 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 748 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  35.42 
 
 		 748 aa  363  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  35.42 
 
 		 748 aa  363  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 747 aa  362  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  34.49 
 
 		 747 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  33.55 
 
 		 730 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  33.55 
 
 		 730 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  33.55 
 
 		 730 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  35.26 
 
 		 748 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 		 730 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 747 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 747 aa  351  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 747 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 747 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 		 747 aa  349  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 766 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 		 749 aa  349  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 780 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 		 763 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  33.07 
 
 		 731 aa  342  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 731 aa  341  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 731 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 		 741 aa  336  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  32.27 
 
 		 730 aa  335  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 826 aa  334  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 		 724 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 767 aa  327  7e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 768 aa  327  8.000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 779 aa  326  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 		 768 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 769 aa  323  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  34.53 
 
 		 760 aa  322  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  33.55 
 
 		 773 aa  317  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  31.57 
 
 		 761 aa  313  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 740 aa  313  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0611  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 773 aa  302  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000075991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 741 aa  297  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 762 aa  291  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 794 aa  287  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 733 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  29.8 
 
 		 765 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 776 aa  270  8.999999999999999e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 731 aa  267  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 821 aa  266  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 732 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 733 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  28.42 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 733 aa  241  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 790 aa  233  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 732 aa  233  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 732 aa  230  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  28.61 
 
 		 760 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 764 aa  229  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 751 aa  229  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 777 aa  228  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  28.84 
 
 		 760 aa  228  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  28.84 
 
 		 760 aa  228  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 760 aa  228  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  28.71 
 
 		 760 aa  228  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  28.84 
 
 		 760 aa  228  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  28.84 
 
 		 760 aa  228  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  27.49 
 
 		 754 aa  227  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 742 aa  225  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 742 aa  225  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  28.57 
 
 		 760 aa  224  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  26.21 
 
 		 779 aa  224  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 751 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 769 aa  223  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  26.47 
 
 		 763 aa  222  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 753 aa  220  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 734 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 769 aa  219  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 745 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 733 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 733 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 736 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 748 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 803 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 823 aa  197  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 785 aa  193  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 847 aa  191  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 720 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 759 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 771 aa  180  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 815 aa  178  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 724 aa  170  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 705 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 724 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>