More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03559 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  49.16 
 
 		 767 aa  654    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  49.16 
 
 		 768 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  55.99 
 
 		 779 aa  823    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  100 
 
 		 761 aa  1556    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0611  TonB-dependent receptor  69.59 
 
 		 773 aa  1102    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000075991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 		 793 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 793 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  31.69 
 
 		 794 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 805 aa  336  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 859 aa  312  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 731 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 731 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  30.63 
 
 		 753 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 731 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 747 aa  302  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  30.58 
 
 		 730 aa  298  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  30.84 
 
 		 843 aa  297  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 730 aa  290  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 730 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 730 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 730 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 747 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 747 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 747 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 747 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 748 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  30.46 
 
 		 748 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 747 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 748 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 747 aa  280  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 766 aa  280  9e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 748 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 		 773 aa  278  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  29.63 
 
 		 772 aa  276  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 724 aa  273  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 731 aa  272  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 749 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 753 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 780 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 763 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 760 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 768 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 741 aa  257  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 769 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 740 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  29.83 
 
 		 765 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 759 aa  253  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 759 aa  251  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 751 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 741 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  28.57 
 
 		 743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 794 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 762 aa  240  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 732 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 733 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  28.35 
 
 		 754 aa  225  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 826 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  27.44 
 
 		 760 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 733 aa  224  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 764 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  27.44 
 
 		 760 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  27.44 
 
 		 760 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  27.32 
 
 		 760 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 760 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  27.32 
 
 		 760 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  27.32 
 
 		 760 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  27.32 
 
 		 760 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 769 aa  218  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 776 aa  217  8e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 769 aa  214  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 803 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 790 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 733 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  27.05 
 
 		 763 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 821 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  27.01 
 
 		 779 aa  201  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 785 aa  195  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 733 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 733 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 693 aa  189  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 847 aa  188  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 727 aa  185  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 742 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 742 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 719 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 823 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 755 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 751 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 735 aa  173  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 792 aa  172  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 753 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 732 aa  171  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 732 aa  171  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 720 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3526  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 722 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 734 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 		 710 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 		 770 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 737 aa  162  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 748 aa  160  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>