More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02662 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 693 aa  1402    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  38.59 
 
 		 735 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  39.22 
 
 		 707 aa  455  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 727 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 		 771 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  33.99 
 
 		 724 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 724 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 		 755 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 705 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 755 aa  364  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  32.96 
 
 		 719 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 756 aa  360  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 770 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 710 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 792 aa  263  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 719 aa  254  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 710 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  30.34 
 
 		 753 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 698 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 689 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 706 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 706 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 734 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 		 689 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  30.17 
 
 		 680 aa  236  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 860 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 700 aa  234  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 		 731 aa  234  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 747 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 707 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 757 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 821 aa  227  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 709 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 732 aa  226  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  30.64 
 
 		 678 aa  226  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  28.47 
 
 		 695 aa  225  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 736 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 734 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 732 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 769 aa  217  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 745 aa  217  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 733 aa  216  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 766 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 708 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  27.03 
 
 		 743 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 773 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 715 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 730 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 759 aa  210  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 694 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 730 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 733 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 730 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 732 aa  207  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 730 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 731 aa  206  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 731 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 760 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 740 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 731 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 759 aa  204  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 724 aa  204  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 768 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 753 aa  203  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 780 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 753 aa  201  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 763 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 689 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 751 aa  201  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 724 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 742 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 742 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  26.28 
 
 		 730 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 724 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 817 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 751 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 723 aa  196  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 714 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 864 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 733 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 826 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 749 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 741 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 709 aa  191  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  28.32 
 
 		 765 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 		 747 aa  190  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 715 aa  190  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 747 aa  188  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  27.09 
 
 		 761 aa  188  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 747 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 701 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 747 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 714 aa  187  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 747 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 737 aa  186  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 859 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 762 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 843 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 747 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>