More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2053 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  67.55 
 
 		 724 aa  966    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  57.67 
 
 		 756 aa  788    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  52.82 
 
 		 771 aa  726    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  68.07 
 
 		 724 aa  974    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  68.38 
 
 		 705 aa  975    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  56.92 
 
 		 755 aa  789    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 719 aa  1455    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  44.23 
 
 		 727 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  44.49 
 
 		 755 aa  531  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  41.12 
 
 		 707 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  39.62 
 
 		 735 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 693 aa  379  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 		 709 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 		 757 aa  366  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 710 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 770 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 707 aa  342  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 		 710 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  34.67 
 
 		 792 aa  341  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 		 719 aa  330  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 		 694 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 		 706 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 		 706 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 		 715 aa  313  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  34.78 
 
 		 695 aa  307  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 700 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  31.19 
 
 		 680 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 726 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 726 aa  264  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 743 aa  262  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 		 726 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 747 aa  260  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  31.61 
 
 		 689 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  29.47 
 
 		 753 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 689 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 745 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 712 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 749 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 656 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 732 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 698 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 732 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 732 aa  252  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  30.31 
 
 		 772 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 747 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 766 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 747 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 777 aa  246  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 724 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 708 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 748 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  30.56 
 
 		 748 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 748 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 747 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 747 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 748 aa  244  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 747 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 747 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 749 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 821 aa  241  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 769 aa  240  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 733 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 860 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 734 aa  239  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 730 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 740 aa  237  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 730 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 742 aa  235  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 742 aa  235  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 730 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 730 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 753 aa  233  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 731 aa  233  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 769 aa  233  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 780 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.96 
 
 		 711 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 731 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 760 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 763 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 736 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 734 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 768 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 736 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 826 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 732 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 731 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 711 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 817 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 731 aa  220  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 733 aa  220  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 829 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 751 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  27.98 
 
 		 765 aa  219  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 759 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 738 aa  219  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 753 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 714 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 741 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 734 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 825 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>