More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001067 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  100 
 
 		 678 aa  1390    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  59.85 
 
 		 699 aa  831    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 792 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 707 aa  261  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 694 aa  250  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  32 
 
 		 715 aa  250  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 719 aa  249  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 770 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 710 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 710 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 745 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  27.87 
 
 		 680 aa  231  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 837 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 706 aa  228  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 706 aa  228  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 693 aa  226  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 734 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 850 aa  224  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 757 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 689 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 709 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 732 aa  219  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 736 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  28.24 
 
 		 695 aa  218  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 734 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 689 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 732 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 698 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 753 aa  207  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 825 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 727 aa  205  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 825 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 692 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 735 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 712 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 696 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.97 
 
 		 696 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 707 aa  200  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 751 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 749 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 742 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 742 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 821 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 700 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 766 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 703 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 656 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 689 aa  196  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 721 aa  194  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 701 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 771 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.31 
 
 		 709 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 708 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.06 
 
 		 703 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 860 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 726 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 859 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.88 
 
 		 703 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 719 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.66 
 
 		 718 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 723 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 815 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 722 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 714 aa  187  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 817 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 755 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 713 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 724 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 707 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 708 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.51 
 
 		 724 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.55 
 
 		 708 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 736 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 705 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 732 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 712 aa  183  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 731 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 733 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 		 864 aa  181  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 724 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 793 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 708 aa  180  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 862 aa  180  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 778 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 709 aa  178  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  25.49 
 
 		 729 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  25.14 
 
 		 729 aa  178  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 730 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 736 aa  177  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  25.17 
 
 		 729 aa  177  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 705 aa  177  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 747 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.3 
 
 		 711 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  26.76 
 
 		 794 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 701 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  25.96 
 
 		 729 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 719 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 730 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 814 aa  175  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 730 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>